Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV92

NDFIP2, NEDD4 family-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP2Q9NV92 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NDFIP2Q9NV92 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NDFIP2Q9NV92 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NDFIP2Q9NV92 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NDFIP2Q9NV92 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NDFIP2Q9NV92 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NDFIP2Q9NV92 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NDFIP2Q9NV92 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NDFIP2Q9NV92 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NDFIP2Q9NV92 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NDFIP2Q9NV92 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NDFIP2Q9NV92 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NDFIP2Q9NV92 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NDFIP2Q9NV92 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NDFIP2Q9NV92 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NDFIP2Q9NV92 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NDFIP2Q9NV92 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NDFIP2Q9NV92 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NDFIP2Q9NV92 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NDFIP2Q9NV92 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NDFIP2Q9NV92 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NDFIP2Q9NV92 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NDFIP2Q9NV92 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NDFIP2Q9NV92 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NDFIP2Q9NV92 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NDFIP2Q9NV92 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NDFIP2Q9NV92 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NDFIP2Q9NV92 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NDFIP2Q9NV92 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NDFIP2Q9NV92 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NDFIP2Q9NV92 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NDFIP2Q9NV92 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NDFIP2Q9NV92 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NDFIP2Q9NV92 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NDFIP2Q9NV92 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NDFIP2Q9NV92 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NDFIP2Q9NV92 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NDFIP2Q9NV92 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NDFIP2Q9NV92 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NDFIP2Q9NV92 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NDFIP2Q9NV92 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NDFIP2Q9NV92 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NDFIP2Q9NV92 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NDFIP2Q9NV92 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NDFIP2Q9NV92 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NDFIP2Q9NV92 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NDFIP2Q9NV92 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NDFIP2Q9NV92 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NDFIP2Q9NV92 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NDFIP2Q9NV92 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NDFIP2Q9NV92 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NDFIP2Q9NV92 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NDFIP2Q9NV92 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NDFIP2Q9NV92 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NDFIP2Q9NV92 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NDFIP2Q9NV92 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NDFIP2Q9NV92 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NDFIP2Q9NV92 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NDFIP2Q9NV92 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NDFIP2Q9NV92 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NDFIP2Q9NV92 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NDFIP2Q9NV92 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NDFIP2Q9NV92 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NDFIP2Q9NV92 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NDFIP2Q9NV92 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NDFIP2Q9NV92 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NDFIP2Q9NV92 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NDFIP2Q9NV92 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NDFIP2Q9NV92 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NDFIP2Q9NV92 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NDFIP2Q9NV92 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NDFIP2Q9NV92 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NDFIP2Q9NV92 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NDFIP2Q9NV92 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NDFIP2Q9NV92 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NDFIP2Q9NV92 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NDFIP2Q9NV92 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NDFIP2Q9NV92 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NDFIP2Q9NV92 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NDFIP2Q9NV92 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NDFIP2Q9NV92 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NDFIP2Q9NV92 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NDFIP2Q9NV92 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NDFIP2Q9NV92 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NDFIP2Q9NV92 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NDFIP2Q9NV92 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NDFIP2Q9NV92 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NDFIP2Q9NV92 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NDFIP2Q9NV92 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NDFIP2Q9NV92 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NDFIP2Q9NV92 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NDFIP2Q9NV92 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NDFIP2Q9NV92 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NDFIP2Q9NV92 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NDFIP2Q9NV92 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NDFIP2Q9NV92 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NDFIP2Q9NV92 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NDFIP2Q9NV92 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NDFIP2Q9NV92 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NDFIP2Q9NV92 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms