Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC37.52■■■■□ 3.6
DUOX2Q9NRD8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
DUOX2Q9NRD8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
DUOX2Q9NRD8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
DUOX2Q9NRD8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
DUOX2Q9NRD8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
DUOX2Q9NRD8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC37.51■■■■□ 3.59
DUOX2Q9NRD8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
DUOX2Q9NRD8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
DUOX2Q9NRD8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
DUOX2Q9NRD8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
DUOX2Q9NRD8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
DUOX2Q9NRD8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
DUOX2Q9NRD8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
DUOX2Q9NRD8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
DUOX2Q9NRD8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
DUOX2Q9NRD8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
DUOX2Q9NRD8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
DUOX2Q9NRD8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
DUOX2Q9NRD8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
DUOX2Q9NRD8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
DUOX2Q9NRD8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC37.46■■■■□ 3.59
DUOX2Q9NRD8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
DUOX2Q9NRD8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
DUOX2Q9NRD8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
DUOX2Q9NRD8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
DUOX2Q9NRD8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
DUOX2Q9NRD8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
DUOX2Q9NRD8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
DUOX2Q9NRD8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
DUOX2Q9NRD8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
DUOX2Q9NRD8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
DUOX2Q9NRD8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
DUOX2Q9NRD8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
DUOX2Q9NRD8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
DUOX2Q9NRD8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
DUOX2Q9NRD8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
DUOX2Q9NRD8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
DUOX2Q9NRD8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
DUOX2Q9NRD8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
DUOX2Q9NRD8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
DUOX2Q9NRD8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC37.4■■■■□ 3.58
DUOX2Q9NRD8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
DUOX2Q9NRD8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
DUOX2Q9NRD8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
DUOX2Q9NRD8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
DUOX2Q9NRD8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
DUOX2Q9NRD8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
DUOX2Q9NRD8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
DUOX2Q9NRD8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.37■■■■□ 3.57
DUOX2Q9NRD8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
DUOX2Q9NRD8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
DUOX2Q9NRD8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
DUOX2Q9NRD8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
DUOX2Q9NRD8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
DUOX2Q9NRD8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
DUOX2Q9NRD8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
DUOX2Q9NRD8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
DUOX2Q9NRD8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
DUOX2Q9NRD8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
DUOX2Q9NRD8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
DUOX2Q9NRD8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
DUOX2Q9NRD8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC37.33■■■■□ 3.57
DUOX2Q9NRD8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
DUOX2Q9NRD8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
DUOX2Q9NRD8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
DUOX2Q9NRD8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
DUOX2Q9NRD8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC37.32■■■■□ 3.57
DUOX2Q9NRD8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC37.32■■■■□ 3.57
DUOX2Q9NRD8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
DUOX2Q9NRD8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC37.31■■■■□ 3.56
DUOX2Q9NRD8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
DUOX2Q9NRD8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC37.3■■■■□ 3.56
DUOX2Q9NRD8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC37.3■■■■□ 3.56
DUOX2Q9NRD8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
DUOX2Q9NRD8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
DUOX2Q9NRD8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
DUOX2Q9NRD8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
DUOX2Q9NRD8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
DUOX2Q9NRD8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
DUOX2Q9NRD8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC37.28■■■■□ 3.56
DUOX2Q9NRD8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
DUOX2Q9NRD8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
DUOX2Q9NRD8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
DUOX2Q9NRD8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
DUOX2Q9NRD8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
DUOX2Q9NRD8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
DUOX2Q9NRD8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC37.26■■■■□ 3.55
DUOX2Q9NRD8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
DUOX2Q9NRD8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
DUOX2Q9NRD8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
DUOX2Q9NRD8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
DUOX2Q9NRD8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
DUOX2Q9NRD8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
DUOX2Q9NRD8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC37.23■■■■□ 3.55
DUOX2Q9NRD8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC37.23■■■■□ 3.55
DUOX2Q9NRD8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
DUOX2Q9NRD8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
DUOX2Q9NRD8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
DUOX2Q9NRD8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms