Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR80

ARHGEF4, Rho guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

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Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF4Q9NR80 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARHGEF4Q9NR80 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARHGEF4Q9NR80 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARHGEF4Q9NR80 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARHGEF4Q9NR80 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARHGEF4Q9NR80 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARHGEF4Q9NR80 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ARHGEF4Q9NR80 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARHGEF4Q9NR80 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARHGEF4Q9NR80 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARHGEF4Q9NR80 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARHGEF4Q9NR80 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARHGEF4Q9NR80 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARHGEF4Q9NR80 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARHGEF4Q9NR80 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARHGEF4Q9NR80 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARHGEF4Q9NR80 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ARHGEF4Q9NR80 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARHGEF4Q9NR80 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARHGEF4Q9NR80 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ARHGEF4Q9NR80 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARHGEF4Q9NR80 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ARHGEF4Q9NR80 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARHGEF4Q9NR80 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARHGEF4Q9NR80 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARHGEF4Q9NR80 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARHGEF4Q9NR80 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARHGEF4Q9NR80 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARHGEF4Q9NR80 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARHGEF4Q9NR80 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ARHGEF4Q9NR80 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARHGEF4Q9NR80 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARHGEF4Q9NR80 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARHGEF4Q9NR80 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARHGEF4Q9NR80 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARHGEF4Q9NR80 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARHGEF4Q9NR80 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARHGEF4Q9NR80 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARHGEF4Q9NR80 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARHGEF4Q9NR80 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARHGEF4Q9NR80 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARHGEF4Q9NR80 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARHGEF4Q9NR80 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ARHGEF4Q9NR80 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARHGEF4Q9NR80 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARHGEF4Q9NR80 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARHGEF4Q9NR80 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARHGEF4Q9NR80 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARHGEF4Q9NR80 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARHGEF4Q9NR80 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARHGEF4Q9NR80 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARHGEF4Q9NR80 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARHGEF4Q9NR80 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARHGEF4Q9NR80 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARHGEF4Q9NR80 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARHGEF4Q9NR80 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARHGEF4Q9NR80 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARHGEF4Q9NR80 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARHGEF4Q9NR80 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARHGEF4Q9NR80 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARHGEF4Q9NR80 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ARHGEF4Q9NR80 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARHGEF4Q9NR80 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ARHGEF4Q9NR80 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARHGEF4Q9NR80 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARHGEF4Q9NR80 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARHGEF4Q9NR80 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARHGEF4Q9NR80 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ARHGEF4Q9NR80 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARHGEF4Q9NR80 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ARHGEF4Q9NR80 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ARHGEF4Q9NR80 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26■■□□□ 1.75
ARHGEF4Q9NR80 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ARHGEF4Q9NR80 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ARHGEF4Q9NR80 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARHGEF4Q9NR80 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARHGEF4Q9NR80 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARHGEF4Q9NR80 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARHGEF4Q9NR80 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARHGEF4Q9NR80 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARHGEF4Q9NR80 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARHGEF4Q9NR80 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARHGEF4Q9NR80 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARHGEF4Q9NR80 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARHGEF4Q9NR80 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARHGEF4Q9NR80 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARHGEF4Q9NR80 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARHGEF4Q9NR80 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARHGEF4Q9NR80 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARHGEF4Q9NR80 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARHGEF4Q9NR80 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARHGEF4Q9NR80 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARHGEF4Q9NR80 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARHGEF4Q9NR80 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARHGEF4Q9NR80 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARHGEF4Q9NR80 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARHGEF4Q9NR80 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARHGEF4Q9NR80 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARHGEF4Q9NR80 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ARHGEF4Q9NR80 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
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