Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR31

SAR1A, GTP-binding protein SAR1a, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAR1AQ9NR31 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SAR1AQ9NR31 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SAR1AQ9NR31 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SAR1AQ9NR31 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SAR1AQ9NR31 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SAR1AQ9NR31 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SAR1AQ9NR31 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SAR1AQ9NR31 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SAR1AQ9NR31 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SAR1AQ9NR31 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SAR1AQ9NR31 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SAR1AQ9NR31 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SAR1AQ9NR31 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SAR1AQ9NR31 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SAR1AQ9NR31 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SAR1AQ9NR31 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SAR1AQ9NR31 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SAR1AQ9NR31 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SAR1AQ9NR31 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SAR1AQ9NR31 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SAR1AQ9NR31 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SAR1AQ9NR31 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SAR1AQ9NR31 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SAR1AQ9NR31 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SAR1AQ9NR31 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SAR1AQ9NR31 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SAR1AQ9NR31 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SAR1AQ9NR31 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SAR1AQ9NR31 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SAR1AQ9NR31 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SAR1AQ9NR31 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SAR1AQ9NR31 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SAR1AQ9NR31 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SAR1AQ9NR31 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SAR1AQ9NR31 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SAR1AQ9NR31 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SAR1AQ9NR31 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SAR1AQ9NR31 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SAR1AQ9NR31 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SAR1AQ9NR31 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SAR1AQ9NR31 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SAR1AQ9NR31 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SAR1AQ9NR31 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SAR1AQ9NR31 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SAR1AQ9NR31 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SAR1AQ9NR31 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SAR1AQ9NR31 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SAR1AQ9NR31 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SAR1AQ9NR31 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SAR1AQ9NR31 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SAR1AQ9NR31 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SAR1AQ9NR31 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SAR1AQ9NR31 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SAR1AQ9NR31 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SAR1AQ9NR31 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SAR1AQ9NR31 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SAR1AQ9NR31 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SAR1AQ9NR31 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SAR1AQ9NR31 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SAR1AQ9NR31 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SAR1AQ9NR31 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SAR1AQ9NR31 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SAR1AQ9NR31 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SAR1AQ9NR31 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SAR1AQ9NR31 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SAR1AQ9NR31 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SAR1AQ9NR31 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SAR1AQ9NR31 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SAR1AQ9NR31 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SAR1AQ9NR31 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SAR1AQ9NR31 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SAR1AQ9NR31 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SAR1AQ9NR31 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SAR1AQ9NR31 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SAR1AQ9NR31 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SAR1AQ9NR31 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SAR1AQ9NR31 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SAR1AQ9NR31 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SAR1AQ9NR31 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SAR1AQ9NR31 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SAR1AQ9NR31 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SAR1AQ9NR31 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SAR1AQ9NR31 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SAR1AQ9NR31 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SAR1AQ9NR31 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SAR1AQ9NR31 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SAR1AQ9NR31 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SAR1AQ9NR31 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SAR1AQ9NR31 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SAR1AQ9NR31 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SAR1AQ9NR31 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SAR1AQ9NR31 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SAR1AQ9NR31 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SAR1AQ9NR31 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SAR1AQ9NR31 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SAR1AQ9NR31 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SAR1AQ9NR31 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SAR1AQ9NR31 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SAR1AQ9NR31 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SAR1AQ9NR31 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms