Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.491e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.31e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.281e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.271e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.221e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 MUC3A-202ENST00000414964 4399 ntTSL 516.01■□□□□ 0.151e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.121e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.071e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 DDX41-212ENST00000511040 721 ntTSL 315□□□□□ -0.011e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 TGFBRAP1-203ENST00000595531 5595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.021e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 ZNF410-214ENST00000555730 567 ntTSL 414.9□□□□□ -0.021e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 NINJ2-204ENST00000537416 323 ntTSL 314.73□□□□□ -0.051e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 ARHGAP11B-209ENST00000602616 5637 ntTSL 314.49□□□□□ -0.091e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 PIPOX-206ENST00000577182 633 ntTSL 514.43□□□□□ -0.11e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.131e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 DDX41-204ENST00000504807 794 ntTSL 214.01□□□□□ -0.171e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 DPF3-206ENST00000554594 562 ntTSL 313.76□□□□□ -0.211e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 ZNF483-203ENST00000358151 2433 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.221e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 ZNF410-217ENST00000556396 1961 ntTSL 213.38□□□□□ -0.271e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 AC124947.1-201ENST00000552835 814 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.281e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 ACSBG1-214ENST00000560817 2462 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.291e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 HDC-207ENST00000559816 2046 ntTSL 212.98□□□□□ -0.331e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 HDC-202ENST00000543581 2180 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.341e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 AC124947.1-202ENST00000549806 332 ntTSL 512.61□□□□□ -0.391e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 HDC-201ENST00000267845 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.391e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 MUC3A-201ENST00000379458 11226 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.411e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 PRMT2-205ENST00000397637 2880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.421e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 FRG1-201ENST00000226798 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.461e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 DPF3-214ENST00000557704 3755 ntTSL 211.79□□□□□ -0.521e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 ZNF410-212ENST00000555602 868 ntTSL 1 (best)11.68□□□□□ -0.541e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 G2E3-AS1-203ENST00000550680 471 ntTSL 311.64□□□□□ -0.551e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 DDX41-216ENST00000513562 552 ntTSL 411.57□□□□□ -0.561e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 PIPOX-207ENST00000578748 790 ntTSL 311.47□□□□□ -0.571e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 ZNF410-209ENST00000554582 888 ntTSL 511.35□□□□□ -0.591e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 FLNB-211ENST00000484981 932 ntTSL 511.09□□□□□ -0.631e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 DPF3-209ENST00000556238 513 ntTSL 211.08□□□□□ -0.641e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 DPF3-215ENST00000610283 4520 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.681e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 HCFC1R1-206ENST00000574151 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.751e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 NINJ2-203ENST00000433832 945 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.761e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 NINJ2-205ENST00000542920 670 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.761e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 ZNF410-219ENST00000556797 1311 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.781e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 DPF3-203ENST00000541685 4077 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.791e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 ZNF483-202ENST00000355824 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.791e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 DDX41-209ENST00000508279 776 ntTSL 510.08□□□□□ -0.81e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 MUC3A-203ENST00000483366 9944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.811e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 DPF3-216ENST00000614862 4221 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.821e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 ZNF410-218ENST00000556659 595 ntTSL 49.9□□□□□ -0.821e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 ZNF410-221ENST00000557363 571 ntTSL 49.9□□□□□ -0.821e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 ZNF410-205ENST00000442160 2076 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.831e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 DPF3-202ENST00000381216 3229 ntTSL 1 (best)9.81□□□□□ -0.841e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.881e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 AC005520.1-201ENST00000556551 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.881e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 FRG1-205ENST00000524583 755 ntTSL 59.39□□□□□ -0.911e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 FRG1-207ENST00000533157 714 ntTSL 59.39□□□□□ -0.911e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 NINJ2-202ENST00000397265 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.911e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 AC124947.1-203ENST00000548890 329 ntTSL 59.33□□□□□ -0.921e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 ZNF410-224ENST00000615736 1551 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.921e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 TPTE2-206ENST00000462409 1220 ntTSL 59.02□□□□□ -0.971e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 ZNF410-222ENST00000557495 587 ntTSL 48.98□□□□□ -0.971e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 DPF3-201ENST00000366353 3687 ntTSL 28.57□□□□□ -1.041e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 ZNF410-204ENST00000412490 1419 ntTSL 58.45□□□□□ -1.061e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 ZNF410-207ENST00000541357 1212 ntTSL 28.43□□□□□ -1.061e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 ARHGAP11B-202ENST00000562954 652 ntTSL 38.4□□□□□ -1.061e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 ACSBG1-206ENST00000558793 573 ntTSL 48.23□□□□□ -1.091e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 ACSBG1-207ENST00000558828 600 ntTSL 47.99□□□□□ -1.131e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.171e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 ZNF410-203ENST00000398139 2461 ntTSL 1 (best)7.43□□□□□ -1.221e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 ZNF410-202ENST00000334521 2193 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.231e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 FRG1-206ENST00000531991 738 ntTSL 57.29□□□□□ -1.241e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.341e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.351e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.361e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 POP1-204ENST00000522319 585 ntTSL 46.32□□□□□ -1.41e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 ZNF410-210ENST00000554797 537 ntTSL 26.17□□□□□ -1.421e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.51e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.531e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.531e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.561e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.671e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.81e-21■■■■■ 521.7
UTP3Q9NQZ2 DDX54-208ENST00000551344 872 ntTSL 520.18■□□□□ 0.822e-18■■■■■ 519.3
UTP3Q9NQZ2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.522e-9■■■■■ 516.9
UTP3Q9NQZ2 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.13e-8■■■■■ 516.6
UTP3Q9NQZ2 PPM1F-206ENST00000484588 348 ntTSL 510.15□□□□□ -0.782e-6■■■■■ 514.7
UTP3Q9NQZ2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.383e-6■■■■■ 513.6
UTP3Q9NQZ2 CCDC138-207ENST00000608781 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 38.19□□□□□ -1.12e-49■■■■■ 512.4
UTP3Q9NQZ2 CTNS-204ENST00000452111 617 ntTSL 319.14■□□□□ 0.653e-13■■■■■ 511.3
UTP3Q9NQZ2 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.63e-13■■■■■ 511.3
UTP3Q9NQZ2 CTNS-207ENST00000495445 536 ntTSL 218.35■□□□□ 0.533e-13■■■■■ 511.3
UTP3Q9NQZ2 CTNS-206ENST00000488623 537 ntTSL 316.32■□□□□ 0.23e-13■■■■■ 511.3
UTP3Q9NQZ2 CTNS-209ENST00000574776 565 ntTSL 416.13■□□□□ 0.173e-13■■■■■ 511.3
UTP3Q9NQZ2 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.133e-13■■■■■ 511.3
UTP3Q9NQZ2 CTNS-201ENST00000046640 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.113e-13■■■■■ 511.3
UTP3Q9NQZ2 CTNS-205ENST00000467663 590 ntTSL 312.68□□□□□ -0.383e-13■■■■■ 511.3
UTP3Q9NQZ2 CTNS-208ENST00000574218 581 ntTSL 512.66□□□□□ -0.383e-13■■■■■ 511.3
UTP3Q9NQZ2 CTNS-210ENST00000576979 548 ntTSL 56.42□□□□□ -1.383e-13■■■■■ 511.3
UTP3Q9NQZ2 ACCS-201ENST00000263776 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.375e-7■■■■■ 511
UTP3Q9NQZ2 SF1-219ENST00000496969 455 ntTSL 38.94□□□□□ -0.982e-6■■■■■ 510.2
UTP3Q9NQZ2 TAPT1-AS1-202ENST00000573308 1031 ntTSL 228.58■■■□□ 2.172e-14■■■■■ 509.3
UTP3Q9NQZ2 TAPT1-AS1-201ENST00000570786 2165 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.922e-14■■■■■ 509.3
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 3540.3 ms