Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX5

NPDC1, Neural proliferation differentiation and control protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPDC1Q9NQX5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPDC1Q9NQX5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPDC1Q9NQX5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NPDC1Q9NQX5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPDC1Q9NQX5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPDC1Q9NQX5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPDC1Q9NQX5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NPDC1Q9NQX5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPDC1Q9NQX5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPDC1Q9NQX5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPDC1Q9NQX5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPDC1Q9NQX5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPDC1Q9NQX5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPDC1Q9NQX5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NPDC1Q9NQX5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPDC1Q9NQX5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPDC1Q9NQX5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPDC1Q9NQX5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPDC1Q9NQX5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPDC1Q9NQX5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPDC1Q9NQX5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPDC1Q9NQX5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NPDC1Q9NQX5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NPDC1Q9NQX5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
NPDC1Q9NQX5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NPDC1Q9NQX5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPDC1Q9NQX5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPDC1Q9NQX5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPDC1Q9NQX5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPDC1Q9NQX5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPDC1Q9NQX5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPDC1Q9NQX5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPDC1Q9NQX5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPDC1Q9NQX5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPDC1Q9NQX5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NPDC1Q9NQX5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPDC1Q9NQX5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPDC1Q9NQX5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPDC1Q9NQX5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NPDC1Q9NQX5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPDC1Q9NQX5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPDC1Q9NQX5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPDC1Q9NQX5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPDC1Q9NQX5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPDC1Q9NQX5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPDC1Q9NQX5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPDC1Q9NQX5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPDC1Q9NQX5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPDC1Q9NQX5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPDC1Q9NQX5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPDC1Q9NQX5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPDC1Q9NQX5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NPDC1Q9NQX5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPDC1Q9NQX5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPDC1Q9NQX5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPDC1Q9NQX5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPDC1Q9NQX5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPDC1Q9NQX5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPDC1Q9NQX5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPDC1Q9NQX5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPDC1Q9NQX5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NPDC1Q9NQX5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NPDC1Q9NQX5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPDC1Q9NQX5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPDC1Q9NQX5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPDC1Q9NQX5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPDC1Q9NQX5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPDC1Q9NQX5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NPDC1Q9NQX5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPDC1Q9NQX5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPDC1Q9NQX5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NPDC1Q9NQX5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPDC1Q9NQX5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPDC1Q9NQX5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPDC1Q9NQX5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPDC1Q9NQX5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPDC1Q9NQX5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPDC1Q9NQX5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NPDC1Q9NQX5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPDC1Q9NQX5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPDC1Q9NQX5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPDC1Q9NQX5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPDC1Q9NQX5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPDC1Q9NQX5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPDC1Q9NQX5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPDC1Q9NQX5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPDC1Q9NQX5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPDC1Q9NQX5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPDC1Q9NQX5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPDC1Q9NQX5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPDC1Q9NQX5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPDC1Q9NQX5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NPDC1Q9NQX5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPDC1Q9NQX5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NPDC1Q9NQX5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPDC1Q9NQX5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPDC1Q9NQX5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPDC1Q9NQX5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPDC1Q9NQX5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPDC1Q9NQX5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms