Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV7

PRDM9, Histone-lysine N-methyltransferase PRDM9, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM9Q9NQV7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRDM9Q9NQV7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRDM9Q9NQV7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRDM9Q9NQV7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRDM9Q9NQV7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRDM9Q9NQV7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRDM9Q9NQV7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDM9Q9NQV7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDM9Q9NQV7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDM9Q9NQV7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDM9Q9NQV7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDM9Q9NQV7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDM9Q9NQV7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDM9Q9NQV7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDM9Q9NQV7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDM9Q9NQV7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDM9Q9NQV7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDM9Q9NQV7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDM9Q9NQV7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDM9Q9NQV7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRDM9Q9NQV7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRDM9Q9NQV7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRDM9Q9NQV7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRDM9Q9NQV7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRDM9Q9NQV7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRDM9Q9NQV7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRDM9Q9NQV7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRDM9Q9NQV7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRDM9Q9NQV7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRDM9Q9NQV7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRDM9Q9NQV7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRDM9Q9NQV7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRDM9Q9NQV7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRDM9Q9NQV7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRDM9Q9NQV7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRDM9Q9NQV7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRDM9Q9NQV7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRDM9Q9NQV7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRDM9Q9NQV7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRDM9Q9NQV7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRDM9Q9NQV7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRDM9Q9NQV7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRDM9Q9NQV7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRDM9Q9NQV7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRDM9Q9NQV7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRDM9Q9NQV7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRDM9Q9NQV7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRDM9Q9NQV7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRDM9Q9NQV7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDM9Q9NQV7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDM9Q9NQV7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDM9Q9NQV7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDM9Q9NQV7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDM9Q9NQV7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM9Q9NQV7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM9Q9NQV7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM9Q9NQV7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRDM9Q9NQV7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRDM9Q9NQV7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRDM9Q9NQV7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRDM9Q9NQV7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRDM9Q9NQV7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PRDM9Q9NQV7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRDM9Q9NQV7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRDM9Q9NQV7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRDM9Q9NQV7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRDM9Q9NQV7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRDM9Q9NQV7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRDM9Q9NQV7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRDM9Q9NQV7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRDM9Q9NQV7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRDM9Q9NQV7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRDM9Q9NQV7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRDM9Q9NQV7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRDM9Q9NQV7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM9Q9NQV7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM9Q9NQV7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM9Q9NQV7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM9Q9NQV7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM9Q9NQV7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM9Q9NQV7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRDM9Q9NQV7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRDM9Q9NQV7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRDM9Q9NQV7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PRDM9Q9NQV7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRDM9Q9NQV7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PRDM9Q9NQV7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM9Q9NQV7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM9Q9NQV7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM9Q9NQV7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM9Q9NQV7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM9Q9NQV7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM9Q9NQV7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM9Q9NQV7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM9Q9NQV7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM9Q9NQV7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM9Q9NQV7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM9Q9NQV7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM9Q9NQV7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRDM9Q9NQV7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms