Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQH7

XPNPEP3, Probable Xaa-Pro aminopeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPNPEP3Q9NQH7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
XPNPEP3Q9NQH7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
XPNPEP3Q9NQH7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
XPNPEP3Q9NQH7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
XPNPEP3Q9NQH7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
XPNPEP3Q9NQH7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
XPNPEP3Q9NQH7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
XPNPEP3Q9NQH7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
XPNPEP3Q9NQH7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
XPNPEP3Q9NQH7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
XPNPEP3Q9NQH7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
XPNPEP3Q9NQH7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
XPNPEP3Q9NQH7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
XPNPEP3Q9NQH7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
XPNPEP3Q9NQH7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
XPNPEP3Q9NQH7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
XPNPEP3Q9NQH7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
XPNPEP3Q9NQH7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
XPNPEP3Q9NQH7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
XPNPEP3Q9NQH7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
XPNPEP3Q9NQH7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
XPNPEP3Q9NQH7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
XPNPEP3Q9NQH7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
XPNPEP3Q9NQH7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
XPNPEP3Q9NQH7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
XPNPEP3Q9NQH7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
XPNPEP3Q9NQH7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
XPNPEP3Q9NQH7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
XPNPEP3Q9NQH7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
XPNPEP3Q9NQH7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
XPNPEP3Q9NQH7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
XPNPEP3Q9NQH7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
XPNPEP3Q9NQH7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
XPNPEP3Q9NQH7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
XPNPEP3Q9NQH7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
XPNPEP3Q9NQH7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
XPNPEP3Q9NQH7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
XPNPEP3Q9NQH7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
XPNPEP3Q9NQH7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
XPNPEP3Q9NQH7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
XPNPEP3Q9NQH7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
XPNPEP3Q9NQH7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
XPNPEP3Q9NQH7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
XPNPEP3Q9NQH7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
XPNPEP3Q9NQH7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
XPNPEP3Q9NQH7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
XPNPEP3Q9NQH7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
XPNPEP3Q9NQH7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
XPNPEP3Q9NQH7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
XPNPEP3Q9NQH7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
XPNPEP3Q9NQH7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
XPNPEP3Q9NQH7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
XPNPEP3Q9NQH7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
XPNPEP3Q9NQH7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
XPNPEP3Q9NQH7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
XPNPEP3Q9NQH7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
XPNPEP3Q9NQH7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
XPNPEP3Q9NQH7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
XPNPEP3Q9NQH7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
XPNPEP3Q9NQH7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
XPNPEP3Q9NQH7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
XPNPEP3Q9NQH7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
XPNPEP3Q9NQH7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
XPNPEP3Q9NQH7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
XPNPEP3Q9NQH7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
XPNPEP3Q9NQH7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
XPNPEP3Q9NQH7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
XPNPEP3Q9NQH7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
XPNPEP3Q9NQH7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
XPNPEP3Q9NQH7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
XPNPEP3Q9NQH7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
XPNPEP3Q9NQH7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
XPNPEP3Q9NQH7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
XPNPEP3Q9NQH7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
XPNPEP3Q9NQH7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
XPNPEP3Q9NQH7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
XPNPEP3Q9NQH7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
XPNPEP3Q9NQH7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
XPNPEP3Q9NQH7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
XPNPEP3Q9NQH7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
XPNPEP3Q9NQH7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
XPNPEP3Q9NQH7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
XPNPEP3Q9NQH7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
XPNPEP3Q9NQH7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
XPNPEP3Q9NQH7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
XPNPEP3Q9NQH7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
XPNPEP3Q9NQH7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
XPNPEP3Q9NQH7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
XPNPEP3Q9NQH7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
XPNPEP3Q9NQH7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
XPNPEP3Q9NQH7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
XPNPEP3Q9NQH7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
XPNPEP3Q9NQH7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
XPNPEP3Q9NQH7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
XPNPEP3Q9NQH7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
XPNPEP3Q9NQH7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
XPNPEP3Q9NQH7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
XPNPEP3Q9NQH7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
XPNPEP3Q9NQH7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
XPNPEP3Q9NQH7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms