Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ50

MRPL40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL40Q9NQ50 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MRPL40Q9NQ50 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MRPL40Q9NQ50 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MRPL40Q9NQ50 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MRPL40Q9NQ50 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MRPL40Q9NQ50 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MRPL40Q9NQ50 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRPL40Q9NQ50 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRPL40Q9NQ50 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRPL40Q9NQ50 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRPL40Q9NQ50 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRPL40Q9NQ50 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRPL40Q9NQ50 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRPL40Q9NQ50 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MRPL40Q9NQ50 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
MRPL40Q9NQ50 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
MRPL40Q9NQ50 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MRPL40Q9NQ50 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MRPL40Q9NQ50 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MRPL40Q9NQ50 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MRPL40Q9NQ50 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MRPL40Q9NQ50 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
MRPL40Q9NQ50 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
MRPL40Q9NQ50 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRPL40Q9NQ50 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRPL40Q9NQ50 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRPL40Q9NQ50 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRPL40Q9NQ50 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRPL40Q9NQ50 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPL40Q9NQ50 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPL40Q9NQ50 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPL40Q9NQ50 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPL40Q9NQ50 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPL40Q9NQ50 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPL40Q9NQ50 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MRPL40Q9NQ50 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MRPL40Q9NQ50 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MRPL40Q9NQ50 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
MRPL40Q9NQ50 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
MRPL40Q9NQ50 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
MRPL40Q9NQ50 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
MRPL40Q9NQ50 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
MRPL40Q9NQ50 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MRPL40Q9NQ50 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MRPL40Q9NQ50 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MRPL40Q9NQ50 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MRPL40Q9NQ50 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRPL40Q9NQ50 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRPL40Q9NQ50 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRPL40Q9NQ50 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MRPL40Q9NQ50 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MRPL40Q9NQ50 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MRPL40Q9NQ50 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MRPL40Q9NQ50 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MRPL40Q9NQ50 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MRPL40Q9NQ50 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MRPL40Q9NQ50 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MRPL40Q9NQ50 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MRPL40Q9NQ50 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MRPL40Q9NQ50 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MRPL40Q9NQ50 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MRPL40Q9NQ50 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MRPL40Q9NQ50 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MRPL40Q9NQ50 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MRPL40Q9NQ50 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MRPL40Q9NQ50 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MRPL40Q9NQ50 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MRPL40Q9NQ50 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
MRPL40Q9NQ50 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MRPL40Q9NQ50 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MRPL40Q9NQ50 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MRPL40Q9NQ50 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MRPL40Q9NQ50 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MRPL40Q9NQ50 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MRPL40Q9NQ50 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MRPL40Q9NQ50 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MRPL40Q9NQ50 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MRPL40Q9NQ50 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MRPL40Q9NQ50 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MRPL40Q9NQ50 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MRPL40Q9NQ50 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MRPL40Q9NQ50 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MRPL40Q9NQ50 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MRPL40Q9NQ50 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MRPL40Q9NQ50 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MRPL40Q9NQ50 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MRPL40Q9NQ50 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MRPL40Q9NQ50 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MRPL40Q9NQ50 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MRPL40Q9NQ50 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MRPL40Q9NQ50 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MRPL40Q9NQ50 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MRPL40Q9NQ50 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MRPL40Q9NQ50 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MRPL40Q9NQ50 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MRPL40Q9NQ50 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MRPL40Q9NQ50 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MRPL40Q9NQ50 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MRPL40Q9NQ50 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MRPL40Q9NQ50 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms