Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ASCL3Q9NQ33 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ASCL3Q9NQ33 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ASCL3Q9NQ33 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ASCL3Q9NQ33 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ASCL3Q9NQ33 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ASCL3Q9NQ33 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ASCL3Q9NQ33 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ASCL3Q9NQ33 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ASCL3Q9NQ33 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ASCL3Q9NQ33 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ASCL3Q9NQ33 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ASCL3Q9NQ33 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ASCL3Q9NQ33 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ASCL3Q9NQ33 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ASCL3Q9NQ33 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ASCL3Q9NQ33 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ASCL3Q9NQ33 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ASCL3Q9NQ33 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ASCL3Q9NQ33 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ASCL3Q9NQ33 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ASCL3Q9NQ33 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ASCL3Q9NQ33 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ASCL3Q9NQ33 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ASCL3Q9NQ33 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ASCL3Q9NQ33 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ASCL3Q9NQ33 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ASCL3Q9NQ33 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ASCL3Q9NQ33 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ASCL3Q9NQ33 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ASCL3Q9NQ33 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ASCL3Q9NQ33 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ASCL3Q9NQ33 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ASCL3Q9NQ33 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ASCL3Q9NQ33 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ASCL3Q9NQ33 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ASCL3Q9NQ33 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ASCL3Q9NQ33 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ASCL3Q9NQ33 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ASCL3Q9NQ33 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ASCL3Q9NQ33 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ASCL3Q9NQ33 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ASCL3Q9NQ33 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ASCL3Q9NQ33 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ASCL3Q9NQ33 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ASCL3Q9NQ33 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ASCL3Q9NQ33 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ASCL3Q9NQ33 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ASCL3Q9NQ33 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ASCL3Q9NQ33 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ASCL3Q9NQ33 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ASCL3Q9NQ33 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ASCL3Q9NQ33 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ASCL3Q9NQ33 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ASCL3Q9NQ33 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ASCL3Q9NQ33 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.6 ms