Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP80

PNPLA8, Calcium-independent phospholipase A2-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA8Q9NP80 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PNPLA8Q9NP80 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PNPLA8Q9NP80 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PNPLA8Q9NP80 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PNPLA8Q9NP80 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PNPLA8Q9NP80 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PNPLA8Q9NP80 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PNPLA8Q9NP80 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PNPLA8Q9NP80 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PNPLA8Q9NP80 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PNPLA8Q9NP80 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PNPLA8Q9NP80 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PNPLA8Q9NP80 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PNPLA8Q9NP80 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PNPLA8Q9NP80 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PNPLA8Q9NP80 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PNPLA8Q9NP80 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PNPLA8Q9NP80 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PNPLA8Q9NP80 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PNPLA8Q9NP80 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PNPLA8Q9NP80 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PNPLA8Q9NP80 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PNPLA8Q9NP80 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PNPLA8Q9NP80 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PNPLA8Q9NP80 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PNPLA8Q9NP80 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PNPLA8Q9NP80 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PNPLA8Q9NP80 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PNPLA8Q9NP80 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PNPLA8Q9NP80 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PNPLA8Q9NP80 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PNPLA8Q9NP80 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PNPLA8Q9NP80 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PNPLA8Q9NP80 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PNPLA8Q9NP80 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PNPLA8Q9NP80 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PNPLA8Q9NP80 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PNPLA8Q9NP80 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PNPLA8Q9NP80 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PNPLA8Q9NP80 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PNPLA8Q9NP80 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PNPLA8Q9NP80 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PNPLA8Q9NP80 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PNPLA8Q9NP80 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PNPLA8Q9NP80 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PNPLA8Q9NP80 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PNPLA8Q9NP80 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PNPLA8Q9NP80 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PNPLA8Q9NP80 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PNPLA8Q9NP80 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PNPLA8Q9NP80 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PNPLA8Q9NP80 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PNPLA8Q9NP80 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PNPLA8Q9NP80 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PNPLA8Q9NP80 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PNPLA8Q9NP80 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PNPLA8Q9NP80 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PNPLA8Q9NP80 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PNPLA8Q9NP80 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PNPLA8Q9NP80 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PNPLA8Q9NP80 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PNPLA8Q9NP80 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PNPLA8Q9NP80 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PNPLA8Q9NP80 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PNPLA8Q9NP80 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PNPLA8Q9NP80 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PNPLA8Q9NP80 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PNPLA8Q9NP80 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PNPLA8Q9NP80 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PNPLA8Q9NP80 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PNPLA8Q9NP80 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PNPLA8Q9NP80 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PNPLA8Q9NP80 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PNPLA8Q9NP80 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PNPLA8Q9NP80 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PNPLA8Q9NP80 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PNPLA8Q9NP80 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PNPLA8Q9NP80 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PNPLA8Q9NP80 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PNPLA8Q9NP80 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PNPLA8Q9NP80 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PNPLA8Q9NP80 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PNPLA8Q9NP80 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PNPLA8Q9NP80 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PNPLA8Q9NP80 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PNPLA8Q9NP80 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PNPLA8Q9NP80 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PNPLA8Q9NP80 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PNPLA8Q9NP80 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PNPLA8Q9NP80 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PNPLA8Q9NP80 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PNPLA8Q9NP80 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PNPLA8Q9NP80 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PNPLA8Q9NP80 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PNPLA8Q9NP80 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PNPLA8Q9NP80 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PNPLA8Q9NP80 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PNPLA8Q9NP80 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PNPLA8Q9NP80 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PNPLA8Q9NP80 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms