Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SSU72Q9NP77 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SSU72Q9NP77 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SSU72Q9NP77 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SSU72Q9NP77 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SSU72Q9NP77 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SSU72Q9NP77 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SSU72Q9NP77 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SSU72Q9NP77 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SSU72Q9NP77 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SSU72Q9NP77 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SSU72Q9NP77 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SSU72Q9NP77 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SSU72Q9NP77 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SSU72Q9NP77 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SSU72Q9NP77 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SSU72Q9NP77 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SSU72Q9NP77 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SSU72Q9NP77 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SSU72Q9NP77 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SSU72Q9NP77 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SSU72Q9NP77 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSU72Q9NP77 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSU72Q9NP77 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SSU72Q9NP77 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSU72Q9NP77 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSU72Q9NP77 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSU72Q9NP77 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SSU72Q9NP77 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSU72Q9NP77 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSU72Q9NP77 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSU72Q9NP77 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSU72Q9NP77 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSU72Q9NP77 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSU72Q9NP77 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSU72Q9NP77 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSU72Q9NP77 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSU72Q9NP77 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSU72Q9NP77 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSU72Q9NP77 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSU72Q9NP77 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSU72Q9NP77 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSU72Q9NP77 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSU72Q9NP77 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SSU72Q9NP77 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SSU72Q9NP77 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SSU72Q9NP77 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSU72Q9NP77 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSU72Q9NP77 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSU72Q9NP77 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSU72Q9NP77 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SSU72Q9NP77 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSU72Q9NP77 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSU72Q9NP77 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSU72Q9NP77 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSU72Q9NP77 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSU72Q9NP77 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSU72Q9NP77 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSU72Q9NP77 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSU72Q9NP77 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SSU72Q9NP77 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SSU72Q9NP77 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SSU72Q9NP77 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SSU72Q9NP77 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SSU72Q9NP77 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SSU72Q9NP77 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SSU72Q9NP77 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SSU72Q9NP77 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SSU72Q9NP77 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SSU72Q9NP77 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SSU72Q9NP77 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SSU72Q9NP77 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SSU72Q9NP77 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SSU72Q9NP77 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SSU72Q9NP77 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SSU72Q9NP77 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SSU72Q9NP77 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SSU72Q9NP77 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SSU72Q9NP77 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SSU72Q9NP77 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SSU72Q9NP77 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SSU72Q9NP77 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SSU72Q9NP77 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SSU72Q9NP77 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SSU72Q9NP77 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SSU72Q9NP77 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SSU72Q9NP77 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SSU72Q9NP77 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SSU72Q9NP77 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SSU72Q9NP77 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SSU72Q9NP77 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SSU72Q9NP77 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SSU72Q9NP77 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SSU72Q9NP77 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SSU72Q9NP77 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SSU72Q9NP77 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SSU72Q9NP77 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SSU72Q9NP77 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SSU72Q9NP77 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SSU72Q9NP77 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms