Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP58

ABCB6, ATP-binding cassette sub-family B member 6, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB6Q9NP58 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ABCB6Q9NP58 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ABCB6Q9NP58 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ABCB6Q9NP58 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ABCB6Q9NP58 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ABCB6Q9NP58 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ABCB6Q9NP58 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ABCB6Q9NP58 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ABCB6Q9NP58 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ABCB6Q9NP58 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ABCB6Q9NP58 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ABCB6Q9NP58 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ABCB6Q9NP58 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ABCB6Q9NP58 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ABCB6Q9NP58 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ABCB6Q9NP58 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ABCB6Q9NP58 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ABCB6Q9NP58 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ABCB6Q9NP58 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ABCB6Q9NP58 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ABCB6Q9NP58 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ABCB6Q9NP58 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ABCB6Q9NP58 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ABCB6Q9NP58 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ABCB6Q9NP58 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ABCB6Q9NP58 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ABCB6Q9NP58 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ABCB6Q9NP58 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ABCB6Q9NP58 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ABCB6Q9NP58 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ABCB6Q9NP58 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
ABCB6Q9NP58 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ABCB6Q9NP58 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ABCB6Q9NP58 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ABCB6Q9NP58 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ABCB6Q9NP58 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCB6Q9NP58 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCB6Q9NP58 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCB6Q9NP58 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCB6Q9NP58 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCB6Q9NP58 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ABCB6Q9NP58 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCB6Q9NP58 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCB6Q9NP58 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCB6Q9NP58 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCB6Q9NP58 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCB6Q9NP58 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCB6Q9NP58 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCB6Q9NP58 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCB6Q9NP58 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCB6Q9NP58 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCB6Q9NP58 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCB6Q9NP58 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCB6Q9NP58 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCB6Q9NP58 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCB6Q9NP58 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ABCB6Q9NP58 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCB6Q9NP58 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCB6Q9NP58 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCB6Q9NP58 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCB6Q9NP58 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCB6Q9NP58 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ABCB6Q9NP58 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ABCB6Q9NP58 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ABCB6Q9NP58 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ABCB6Q9NP58 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ABCB6Q9NP58 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCB6Q9NP58 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCB6Q9NP58 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCB6Q9NP58 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCB6Q9NP58 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ABCB6Q9NP58 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ABCB6Q9NP58 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ABCB6Q9NP58 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ABCB6Q9NP58 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ABCB6Q9NP58 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ABCB6Q9NP58 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ABCB6Q9NP58 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ABCB6Q9NP58 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ABCB6Q9NP58 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ABCB6Q9NP58 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ABCB6Q9NP58 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ABCB6Q9NP58 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ABCB6Q9NP58 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ABCB6Q9NP58 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ABCB6Q9NP58 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ABCB6Q9NP58 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ABCB6Q9NP58 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ABCB6Q9NP58 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ABCB6Q9NP58 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ABCB6Q9NP58 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ABCB6Q9NP58 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ABCB6Q9NP58 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ABCB6Q9NP58 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ABCB6Q9NP58 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ABCB6Q9NP58 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ABCB6Q9NP58 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ABCB6Q9NP58 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ABCB6Q9NP58 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ABCB6Q9NP58 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms