Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME2

Chst11, Carbohydrate sulfotransferase 11, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chst11Q9JME2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Chst11Q9JME2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chst11Q9JME2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chst11Q9JME2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chst11Q9JME2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chst11Q9JME2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chst11Q9JME2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chst11Q9JME2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chst11Q9JME2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chst11Q9JME2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chst11Q9JME2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chst11Q9JME2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chst11Q9JME2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chst11Q9JME2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chst11Q9JME2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chst11Q9JME2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chst11Q9JME2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Chst11Q9JME2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chst11Q9JME2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chst11Q9JME2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chst11Q9JME2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chst11Q9JME2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chst11Q9JME2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chst11Q9JME2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chst11Q9JME2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chst11Q9JME2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chst11Q9JME2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chst11Q9JME2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chst11Q9JME2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chst11Q9JME2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chst11Q9JME2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chst11Q9JME2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chst11Q9JME2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chst11Q9JME2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chst11Q9JME2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chst11Q9JME2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chst11Q9JME2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chst11Q9JME2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chst11Q9JME2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chst11Q9JME2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chst11Q9JME2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chst11Q9JME2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chst11Q9JME2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chst11Q9JME2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chst11Q9JME2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chst11Q9JME2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chst11Q9JME2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chst11Q9JME2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chst11Q9JME2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chst11Q9JME2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chst11Q9JME2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chst11Q9JME2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chst11Q9JME2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Chst11Q9JME2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chst11Q9JME2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chst11Q9JME2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Chst11Q9JME2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chst11Q9JME2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chst11Q9JME2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chst11Q9JME2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Chst11Q9JME2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chst11Q9JME2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chst11Q9JME2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Chst11Q9JME2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chst11Q9JME2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chst11Q9JME2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chst11Q9JME2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chst11Q9JME2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Chst11Q9JME2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chst11Q9JME2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Chst11Q9JME2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chst11Q9JME2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Chst11Q9JME2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Chst11Q9JME2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chst11Q9JME2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chst11Q9JME2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Chst11Q9JME2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Chst11Q9JME2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chst11Q9JME2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chst11Q9JME2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Chst11Q9JME2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chst11Q9JME2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chst11Q9JME2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Chst11Q9JME2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Chst11Q9JME2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chst11Q9JME2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chst11Q9JME2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chst11Q9JME2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chst11Q9JME2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chst11Q9JME2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chst11Q9JME2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chst11Q9JME2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chst11Q9JME2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chst11Q9JME2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chst11Q9JME2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chst11Q9JME2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chst11Q9JME2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chst11Q9JME2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chst11Q9JME2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chst11Q9JME2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms