Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

Predictions only

Length 4,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SacsQ9JLC8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SacsQ9JLC8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SacsQ9JLC8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SacsQ9JLC8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SacsQ9JLC8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SacsQ9JLC8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SacsQ9JLC8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SacsQ9JLC8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SacsQ9JLC8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SacsQ9JLC8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SacsQ9JLC8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SacsQ9JLC8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SacsQ9JLC8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SacsQ9JLC8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SacsQ9JLC8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SacsQ9JLC8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SacsQ9JLC8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SacsQ9JLC8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SacsQ9JLC8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SacsQ9JLC8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SacsQ9JLC8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SacsQ9JLC8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SacsQ9JLC8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SacsQ9JLC8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SacsQ9JLC8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SacsQ9JLC8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SacsQ9JLC8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SacsQ9JLC8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SacsQ9JLC8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SacsQ9JLC8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SacsQ9JLC8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SacsQ9JLC8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SacsQ9JLC8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SacsQ9JLC8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SacsQ9JLC8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SacsQ9JLC8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SacsQ9JLC8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SacsQ9JLC8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SacsQ9JLC8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SacsQ9JLC8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SacsQ9JLC8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SacsQ9JLC8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SacsQ9JLC8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SacsQ9JLC8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SacsQ9JLC8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SacsQ9JLC8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SacsQ9JLC8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SacsQ9JLC8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SacsQ9JLC8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SacsQ9JLC8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SacsQ9JLC8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SacsQ9JLC8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SacsQ9JLC8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SacsQ9JLC8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SacsQ9JLC8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SacsQ9JLC8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SacsQ9JLC8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SacsQ9JLC8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SacsQ9JLC8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SacsQ9JLC8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SacsQ9JLC8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SacsQ9JLC8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SacsQ9JLC8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SacsQ9JLC8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SacsQ9JLC8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SacsQ9JLC8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SacsQ9JLC8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SacsQ9JLC8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SacsQ9JLC8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SacsQ9JLC8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SacsQ9JLC8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SacsQ9JLC8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SacsQ9JLC8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SacsQ9JLC8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SacsQ9JLC8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SacsQ9JLC8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SacsQ9JLC8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SacsQ9JLC8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SacsQ9JLC8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC14.65□□□□□ -0.07
SacsQ9JLC8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.07
SacsQ9JLC8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
SacsQ9JLC8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SacsQ9JLC8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SacsQ9JLC8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SacsQ9JLC8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SacsQ9JLC8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SacsQ9JLC8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SacsQ9JLC8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SacsQ9JLC8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SacsQ9JLC8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SacsQ9JLC8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SacsQ9JLC8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SacsQ9JLC8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SacsQ9JLC8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SacsQ9JLC8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SacsQ9JLC8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SacsQ9JLC8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SacsQ9JLC8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SacsQ9JLC8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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