Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pole3Q9JKP7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Pole3Q9JKP7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pole3Q9JKP7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pole3Q9JKP7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Pole3Q9JKP7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pole3Q9JKP7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pole3Q9JKP7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Pole3Q9JKP7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pole3Q9JKP7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pole3Q9JKP7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pole3Q9JKP7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pole3Q9JKP7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pole3Q9JKP7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pole3Q9JKP7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pole3Q9JKP7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pole3Q9JKP7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pole3Q9JKP7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pole3Q9JKP7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Pole3Q9JKP7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pole3Q9JKP7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pole3Q9JKP7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pole3Q9JKP7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pole3Q9JKP7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pole3Q9JKP7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pole3Q9JKP7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pole3Q9JKP7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pole3Q9JKP7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pole3Q9JKP7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Pole3Q9JKP7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pole3Q9JKP7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pole3Q9JKP7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pole3Q9JKP7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pole3Q9JKP7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pole3Q9JKP7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pole3Q9JKP7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pole3Q9JKP7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pole3Q9JKP7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pole3Q9JKP7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Pole3Q9JKP7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pole3Q9JKP7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pole3Q9JKP7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pole3Q9JKP7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pole3Q9JKP7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pole3Q9JKP7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pole3Q9JKP7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pole3Q9JKP7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pole3Q9JKP7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pole3Q9JKP7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Pole3Q9JKP7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pole3Q9JKP7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pole3Q9JKP7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pole3Q9JKP7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pole3Q9JKP7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pole3Q9JKP7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pole3Q9JKP7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pole3Q9JKP7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pole3Q9JKP7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pole3Q9JKP7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pole3Q9JKP7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pole3Q9JKP7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pole3Q9JKP7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pole3Q9JKP7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Pole3Q9JKP7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pole3Q9JKP7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pole3Q9JKP7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pole3Q9JKP7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pole3Q9JKP7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pole3Q9JKP7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pole3Q9JKP7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pole3Q9JKP7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pole3Q9JKP7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pole3Q9JKP7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pole3Q9JKP7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pole3Q9JKP7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pole3Q9JKP7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pole3Q9JKP7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pole3Q9JKP7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pole3Q9JKP7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pole3Q9JKP7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pole3Q9JKP7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pole3Q9JKP7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pole3Q9JKP7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pole3Q9JKP7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pole3Q9JKP7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Pole3Q9JKP7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pole3Q9JKP7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pole3Q9JKP7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pole3Q9JKP7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Pole3Q9JKP7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pole3Q9JKP7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pole3Q9JKP7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pole3Q9JKP7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pole3Q9JKP7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pole3Q9JKP7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pole3Q9JKP7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pole3Q9JKP7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pole3Q9JKP7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pole3Q9JKP7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pole3Q9JKP7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.8 ms