Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AtrQ9JKK8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AtrQ9JKK8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AtrQ9JKK8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AtrQ9JKK8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AtrQ9JKK8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
AtrQ9JKK8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AtrQ9JKK8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AtrQ9JKK8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AtrQ9JKK8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AtrQ9JKK8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AtrQ9JKK8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AtrQ9JKK8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AtrQ9JKK8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AtrQ9JKK8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AtrQ9JKK8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AtrQ9JKK8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
AtrQ9JKK8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AtrQ9JKK8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
AtrQ9JKK8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
AtrQ9JKK8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AtrQ9JKK8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AtrQ9JKK8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AtrQ9JKK8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AtrQ9JKK8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AtrQ9JKK8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AtrQ9JKK8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AtrQ9JKK8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
AtrQ9JKK8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AtrQ9JKK8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
AtrQ9JKK8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
AtrQ9JKK8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AtrQ9JKK8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AtrQ9JKK8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
AtrQ9JKK8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
AtrQ9JKK8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AtrQ9JKK8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AtrQ9JKK8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AtrQ9JKK8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
AtrQ9JKK8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AtrQ9JKK8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AtrQ9JKK8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
AtrQ9JKK8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AtrQ9JKK8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AtrQ9JKK8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AtrQ9JKK8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AtrQ9JKK8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
AtrQ9JKK8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
AtrQ9JKK8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
AtrQ9JKK8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
AtrQ9JKK8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AtrQ9JKK8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
AtrQ9JKK8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AtrQ9JKK8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AtrQ9JKK8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AtrQ9JKK8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AtrQ9JKK8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AtrQ9JKK8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AtrQ9JKK8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AtrQ9JKK8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AtrQ9JKK8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AtrQ9JKK8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AtrQ9JKK8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AtrQ9JKK8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AtrQ9JKK8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AtrQ9JKK8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
AtrQ9JKK8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AtrQ9JKK8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AtrQ9JKK8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
AtrQ9JKK8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AtrQ9JKK8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
AtrQ9JKK8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AtrQ9JKK8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AtrQ9JKK8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AtrQ9JKK8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AtrQ9JKK8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AtrQ9JKK8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AtrQ9JKK8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AtrQ9JKK8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AtrQ9JKK8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AtrQ9JKK8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AtrQ9JKK8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AtrQ9JKK8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
AtrQ9JKK8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
AtrQ9JKK8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
AtrQ9JKK8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AtrQ9JKK8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AtrQ9JKK8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AtrQ9JKK8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AtrQ9JKK8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AtrQ9JKK8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AtrQ9JKK8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AtrQ9JKK8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AtrQ9JKK8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
AtrQ9JKK8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AtrQ9JKK8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AtrQ9JKK8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AtrQ9JKK8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AtrQ9JKK8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AtrQ9JKK8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms