Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ap3m1Q9JKC8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ap3m1Q9JKC8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ap3m1Q9JKC8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ap3m1Q9JKC8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ap3m1Q9JKC8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ap3m1Q9JKC8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ap3m1Q9JKC8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ap3m1Q9JKC8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ap3m1Q9JKC8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ap3m1Q9JKC8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ap3m1Q9JKC8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ap3m1Q9JKC8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ap3m1Q9JKC8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ap3m1Q9JKC8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ap3m1Q9JKC8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ap3m1Q9JKC8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ap3m1Q9JKC8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ap3m1Q9JKC8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ap3m1Q9JKC8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ap3m1Q9JKC8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ap3m1Q9JKC8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ap3m1Q9JKC8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ap3m1Q9JKC8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ap3m1Q9JKC8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ap3m1Q9JKC8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ap3m1Q9JKC8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ap3m1Q9JKC8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ap3m1Q9JKC8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ap3m1Q9JKC8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ap3m1Q9JKC8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ap3m1Q9JKC8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ap3m1Q9JKC8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ap3m1Q9JKC8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ap3m1Q9JKC8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ap3m1Q9JKC8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ap3m1Q9JKC8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ap3m1Q9JKC8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ap3m1Q9JKC8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ap3m1Q9JKC8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ap3m1Q9JKC8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ap3m1Q9JKC8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ap3m1Q9JKC8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ap3m1Q9JKC8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ap3m1Q9JKC8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ap3m1Q9JKC8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ap3m1Q9JKC8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ap3m1Q9JKC8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ap3m1Q9JKC8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ap3m1Q9JKC8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ap3m1Q9JKC8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ap3m1Q9JKC8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ap3m1Q9JKC8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ap3m1Q9JKC8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ap3m1Q9JKC8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ap3m1Q9JKC8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ap3m1Q9JKC8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ap3m1Q9JKC8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ap3m1Q9JKC8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ap3m1Q9JKC8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ap3m1Q9JKC8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ap3m1Q9JKC8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ap3m1Q9JKC8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ap3m1Q9JKC8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ap3m1Q9JKC8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ap3m1Q9JKC8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ap3m1Q9JKC8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ap3m1Q9JKC8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ap3m1Q9JKC8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ap3m1Q9JKC8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ap3m1Q9JKC8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ap3m1Q9JKC8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ap3m1Q9JKC8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ap3m1Q9JKC8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ap3m1Q9JKC8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ap3m1Q9JKC8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ap3m1Q9JKC8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ap3m1Q9JKC8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ap3m1Q9JKC8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ap3m1Q9JKC8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ap3m1Q9JKC8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ap3m1Q9JKC8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ap3m1Q9JKC8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ap3m1Q9JKC8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ap3m1Q9JKC8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ap3m1Q9JKC8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ap3m1Q9JKC8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ap3m1Q9JKC8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ap3m1Q9JKC8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ap3m1Q9JKC8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ap3m1Q9JKC8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ap3m1Q9JKC8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ap3m1Q9JKC8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ap3m1Q9JKC8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ap3m1Q9JKC8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ap3m1Q9JKC8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ap3m1Q9JKC8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ap3m1Q9JKC8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ap3m1Q9JKC8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ap3m1Q9JKC8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 784.7 ms