Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gfra4Q9JJT2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gfra4Q9JJT2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gfra4Q9JJT2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gfra4Q9JJT2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gfra4Q9JJT2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gfra4Q9JJT2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gfra4Q9JJT2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gfra4Q9JJT2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gfra4Q9JJT2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gfra4Q9JJT2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gfra4Q9JJT2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gfra4Q9JJT2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gfra4Q9JJT2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gfra4Q9JJT2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gfra4Q9JJT2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gfra4Q9JJT2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gfra4Q9JJT2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gfra4Q9JJT2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gfra4Q9JJT2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gfra4Q9JJT2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gfra4Q9JJT2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gfra4Q9JJT2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gfra4Q9JJT2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gfra4Q9JJT2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gfra4Q9JJT2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gfra4Q9JJT2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gfra4Q9JJT2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Gfra4Q9JJT2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gfra4Q9JJT2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gfra4Q9JJT2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gfra4Q9JJT2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gfra4Q9JJT2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gfra4Q9JJT2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gfra4Q9JJT2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gfra4Q9JJT2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gfra4Q9JJT2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gfra4Q9JJT2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gfra4Q9JJT2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gfra4Q9JJT2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gfra4Q9JJT2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gfra4Q9JJT2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gfra4Q9JJT2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gfra4Q9JJT2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Gfra4Q9JJT2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gfra4Q9JJT2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gfra4Q9JJT2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gfra4Q9JJT2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gfra4Q9JJT2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gfra4Q9JJT2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gfra4Q9JJT2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gfra4Q9JJT2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gfra4Q9JJT2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gfra4Q9JJT2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gfra4Q9JJT2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Gfra4Q9JJT2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gfra4Q9JJT2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gfra4Q9JJT2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gfra4Q9JJT2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gfra4Q9JJT2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gfra4Q9JJT2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gfra4Q9JJT2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gfra4Q9JJT2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gfra4Q9JJT2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gfra4Q9JJT2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Gfra4Q9JJT2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gfra4Q9JJT2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gfra4Q9JJT2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gfra4Q9JJT2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gfra4Q9JJT2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gfra4Q9JJT2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gfra4Q9JJT2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gfra4Q9JJT2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gfra4Q9JJT2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gfra4Q9JJT2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gfra4Q9JJT2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gfra4Q9JJT2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Gfra4Q9JJT2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gfra4Q9JJT2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gfra4Q9JJT2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gfra4Q9JJT2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gfra4Q9JJT2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gfra4Q9JJT2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gfra4Q9JJT2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gfra4Q9JJT2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gfra4Q9JJT2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gfra4Q9JJT2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Gfra4Q9JJT2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gfra4Q9JJT2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Gfra4Q9JJT2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gfra4Q9JJT2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Gfra4Q9JJT2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Gfra4Q9JJT2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Gfra4Q9JJT2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gfra4Q9JJT2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gfra4Q9JJT2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gfra4Q9JJT2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gfra4Q9JJT2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gfra4Q9JJT2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gfra4Q9JJT2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms