Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS0

Scube2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scube2Q9JJS0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Scube2Q9JJS0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Scube2Q9JJS0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scube2Q9JJS0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scube2Q9JJS0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scube2Q9JJS0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scube2Q9JJS0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scube2Q9JJS0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scube2Q9JJS0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scube2Q9JJS0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scube2Q9JJS0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scube2Q9JJS0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scube2Q9JJS0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scube2Q9JJS0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scube2Q9JJS0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scube2Q9JJS0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scube2Q9JJS0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scube2Q9JJS0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scube2Q9JJS0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scube2Q9JJS0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scube2Q9JJS0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scube2Q9JJS0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scube2Q9JJS0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scube2Q9JJS0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scube2Q9JJS0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scube2Q9JJS0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Scube2Q9JJS0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Scube2Q9JJS0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Scube2Q9JJS0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scube2Q9JJS0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scube2Q9JJS0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scube2Q9JJS0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scube2Q9JJS0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scube2Q9JJS0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scube2Q9JJS0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scube2Q9JJS0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Scube2Q9JJS0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scube2Q9JJS0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scube2Q9JJS0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scube2Q9JJS0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scube2Q9JJS0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scube2Q9JJS0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scube2Q9JJS0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scube2Q9JJS0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scube2Q9JJS0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scube2Q9JJS0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scube2Q9JJS0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scube2Q9JJS0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scube2Q9JJS0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scube2Q9JJS0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scube2Q9JJS0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scube2Q9JJS0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scube2Q9JJS0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scube2Q9JJS0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scube2Q9JJS0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scube2Q9JJS0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scube2Q9JJS0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scube2Q9JJS0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scube2Q9JJS0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scube2Q9JJS0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scube2Q9JJS0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scube2Q9JJS0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Scube2Q9JJS0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Scube2Q9JJS0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scube2Q9JJS0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scube2Q9JJS0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scube2Q9JJS0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scube2Q9JJS0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scube2Q9JJS0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scube2Q9JJS0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scube2Q9JJS0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scube2Q9JJS0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scube2Q9JJS0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scube2Q9JJS0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scube2Q9JJS0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scube2Q9JJS0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scube2Q9JJS0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scube2Q9JJS0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scube2Q9JJS0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scube2Q9JJS0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Scube2Q9JJS0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Scube2Q9JJS0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scube2Q9JJS0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scube2Q9JJS0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Scube2Q9JJS0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Scube2Q9JJS0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scube2Q9JJS0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scube2Q9JJS0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scube2Q9JJS0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scube2Q9JJS0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scube2Q9JJS0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scube2Q9JJS0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scube2Q9JJS0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Scube2Q9JJS0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scube2Q9JJS0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scube2Q9JJS0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scube2Q9JJS0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scube2Q9JJS0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scube2Q9JJS0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scube2Q9JJS0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms