Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHS9

Cwc15, Spliceosome-associated protein CWC15 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc15Q9JHS9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cwc15Q9JHS9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cwc15Q9JHS9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cwc15Q9JHS9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cwc15Q9JHS9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Cwc15Q9JHS9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cwc15Q9JHS9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cwc15Q9JHS9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cwc15Q9JHS9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cwc15Q9JHS9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cwc15Q9JHS9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cwc15Q9JHS9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cwc15Q9JHS9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cwc15Q9JHS9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cwc15Q9JHS9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cwc15Q9JHS9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cwc15Q9JHS9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cwc15Q9JHS9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cwc15Q9JHS9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cwc15Q9JHS9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cwc15Q9JHS9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cwc15Q9JHS9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cwc15Q9JHS9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cwc15Q9JHS9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cwc15Q9JHS9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cwc15Q9JHS9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cwc15Q9JHS9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cwc15Q9JHS9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cwc15Q9JHS9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cwc15Q9JHS9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cwc15Q9JHS9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cwc15Q9JHS9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cwc15Q9JHS9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cwc15Q9JHS9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cwc15Q9JHS9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cwc15Q9JHS9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cwc15Q9JHS9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cwc15Q9JHS9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cwc15Q9JHS9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cwc15Q9JHS9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cwc15Q9JHS9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cwc15Q9JHS9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cwc15Q9JHS9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cwc15Q9JHS9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cwc15Q9JHS9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cwc15Q9JHS9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cwc15Q9JHS9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cwc15Q9JHS9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cwc15Q9JHS9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cwc15Q9JHS9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cwc15Q9JHS9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cwc15Q9JHS9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Cwc15Q9JHS9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cwc15Q9JHS9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cwc15Q9JHS9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cwc15Q9JHS9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cwc15Q9JHS9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Cwc15Q9JHS9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cwc15Q9JHS9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cwc15Q9JHS9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cwc15Q9JHS9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cwc15Q9JHS9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cwc15Q9JHS9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cwc15Q9JHS9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cwc15Q9JHS9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cwc15Q9JHS9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cwc15Q9JHS9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cwc15Q9JHS9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cwc15Q9JHS9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cwc15Q9JHS9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cwc15Q9JHS9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cwc15Q9JHS9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cwc15Q9JHS9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cwc15Q9JHS9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cwc15Q9JHS9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cwc15Q9JHS9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cwc15Q9JHS9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cwc15Q9JHS9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cwc15Q9JHS9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cwc15Q9JHS9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cwc15Q9JHS9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cwc15Q9JHS9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cwc15Q9JHS9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cwc15Q9JHS9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cwc15Q9JHS9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cwc15Q9JHS9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cwc15Q9JHS9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cwc15Q9JHS9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cwc15Q9JHS9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cwc15Q9JHS9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cwc15Q9JHS9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cwc15Q9JHS9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cwc15Q9JHS9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cwc15Q9JHS9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cwc15Q9JHS9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cwc15Q9JHS9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cwc15Q9JHS9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cwc15Q9JHS9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cwc15Q9JHS9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cwc15Q9JHS9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.7 ms