Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GOPCQ9HD26 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GOPCQ9HD26 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GOPCQ9HD26 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GOPCQ9HD26 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GOPCQ9HD26 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GOPCQ9HD26 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GOPCQ9HD26 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GOPCQ9HD26 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GOPCQ9HD26 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GOPCQ9HD26 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GOPCQ9HD26 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GOPCQ9HD26 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GOPCQ9HD26 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GOPCQ9HD26 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GOPCQ9HD26 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GOPCQ9HD26 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GOPCQ9HD26 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
GOPCQ9HD26 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GOPCQ9HD26 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GOPCQ9HD26 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GOPCQ9HD26 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GOPCQ9HD26 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
GOPCQ9HD26 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GOPCQ9HD26 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GOPCQ9HD26 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GOPCQ9HD26 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GOPCQ9HD26 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
GOPCQ9HD26 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GOPCQ9HD26 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GOPCQ9HD26 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GOPCQ9HD26 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
GOPCQ9HD26 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GOPCQ9HD26 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GOPCQ9HD26 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GOPCQ9HD26 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GOPCQ9HD26 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GOPCQ9HD26 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GOPCQ9HD26 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GOPCQ9HD26 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
GOPCQ9HD26 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GOPCQ9HD26 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GOPCQ9HD26 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GOPCQ9HD26 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GOPCQ9HD26 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GOPCQ9HD26 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GOPCQ9HD26 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GOPCQ9HD26 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GOPCQ9HD26 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
GOPCQ9HD26 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GOPCQ9HD26 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GOPCQ9HD26 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GOPCQ9HD26 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GOPCQ9HD26 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GOPCQ9HD26 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GOPCQ9HD26 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GOPCQ9HD26 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GOPCQ9HD26 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GOPCQ9HD26 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GOPCQ9HD26 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GOPCQ9HD26 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
GOPCQ9HD26 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
GOPCQ9HD26 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GOPCQ9HD26 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GOPCQ9HD26 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GOPCQ9HD26 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GOPCQ9HD26 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GOPCQ9HD26 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GOPCQ9HD26 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GOPCQ9HD26 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GOPCQ9HD26 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GOPCQ9HD26 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
GOPCQ9HD26 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GOPCQ9HD26 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GOPCQ9HD26 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GOPCQ9HD26 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
GOPCQ9HD26 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GOPCQ9HD26 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GOPCQ9HD26 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GOPCQ9HD26 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GOPCQ9HD26 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
GOPCQ9HD26 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GOPCQ9HD26 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
GOPCQ9HD26 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GOPCQ9HD26 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GOPCQ9HD26 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GOPCQ9HD26 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GOPCQ9HD26 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GOPCQ9HD26 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GOPCQ9HD26 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GOPCQ9HD26 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GOPCQ9HD26 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GOPCQ9HD26 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
GOPCQ9HD26 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
GOPCQ9HD26 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GOPCQ9HD26 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GOPCQ9HD26 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GOPCQ9HD26 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GOPCQ9HD26 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GOPCQ9HD26 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms