Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIAA1549Q9HCM3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIAA1549Q9HCM3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIAA1549Q9HCM3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIAA1549Q9HCM3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIAA1549Q9HCM3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIAA1549Q9HCM3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIAA1549Q9HCM3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIAA1549Q9HCM3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIAA1549Q9HCM3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIAA1549Q9HCM3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIAA1549Q9HCM3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIAA1549Q9HCM3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIAA1549Q9HCM3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KIAA1549Q9HCM3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIAA1549Q9HCM3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KIAA1549Q9HCM3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIAA1549Q9HCM3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIAA1549Q9HCM3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIAA1549Q9HCM3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIAA1549Q9HCM3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIAA1549Q9HCM3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIAA1549Q9HCM3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIAA1549Q9HCM3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIAA1549Q9HCM3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIAA1549Q9HCM3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIAA1549Q9HCM3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIAA1549Q9HCM3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIAA1549Q9HCM3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KIAA1549Q9HCM3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIAA1549Q9HCM3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIAA1549Q9HCM3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIAA1549Q9HCM3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIAA1549Q9HCM3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KIAA1549Q9HCM3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIAA1549Q9HCM3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIAA1549Q9HCM3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIAA1549Q9HCM3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIAA1549Q9HCM3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIAA1549Q9HCM3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIAA1549Q9HCM3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIAA1549Q9HCM3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIAA1549Q9HCM3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIAA1549Q9HCM3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIAA1549Q9HCM3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIAA1549Q9HCM3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KIAA1549Q9HCM3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIAA1549Q9HCM3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KIAA1549Q9HCM3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIAA1549Q9HCM3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIAA1549Q9HCM3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIAA1549Q9HCM3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIAA1549Q9HCM3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIAA1549Q9HCM3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIAA1549Q9HCM3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIAA1549Q9HCM3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIAA1549Q9HCM3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KIAA1549Q9HCM3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIAA1549Q9HCM3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIAA1549Q9HCM3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIAA1549Q9HCM3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIAA1549Q9HCM3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIAA1549Q9HCM3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIAA1549Q9HCM3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIAA1549Q9HCM3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIAA1549Q9HCM3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIAA1549Q9HCM3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIAA1549Q9HCM3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KIAA1549Q9HCM3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KIAA1549Q9HCM3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KIAA1549Q9HCM3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KIAA1549Q9HCM3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIAA1549Q9HCM3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIAA1549Q9HCM3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIAA1549Q9HCM3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIAA1549Q9HCM3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIAA1549Q9HCM3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIAA1549Q9HCM3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIAA1549Q9HCM3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIAA1549Q9HCM3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIAA1549Q9HCM3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIAA1549Q9HCM3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIAA1549Q9HCM3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIAA1549Q9HCM3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIAA1549Q9HCM3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KIAA1549Q9HCM3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIAA1549Q9HCM3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIAA1549Q9HCM3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIAA1549Q9HCM3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIAA1549Q9HCM3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIAA1549Q9HCM3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIAA1549Q9HCM3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIAA1549Q9HCM3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIAA1549Q9HCM3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIAA1549Q9HCM3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIAA1549Q9HCM3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KIAA1549Q9HCM3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIAA1549Q9HCM3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIAA1549Q9HCM3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIAA1549Q9HCM3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms