Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB58

SP110, Sp110 nuclear body protein, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP110Q9HB58 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SP110Q9HB58 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SP110Q9HB58 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SP110Q9HB58 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SP110Q9HB58 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SP110Q9HB58 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SP110Q9HB58 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SP110Q9HB58 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SP110Q9HB58 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SP110Q9HB58 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SP110Q9HB58 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SP110Q9HB58 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SP110Q9HB58 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SP110Q9HB58 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SP110Q9HB58 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SP110Q9HB58 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SP110Q9HB58 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SP110Q9HB58 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SP110Q9HB58 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SP110Q9HB58 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SP110Q9HB58 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SP110Q9HB58 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SP110Q9HB58 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SP110Q9HB58 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SP110Q9HB58 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SP110Q9HB58 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SP110Q9HB58 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SP110Q9HB58 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SP110Q9HB58 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SP110Q9HB58 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SP110Q9HB58 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SP110Q9HB58 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SP110Q9HB58 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SP110Q9HB58 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SP110Q9HB58 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SP110Q9HB58 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SP110Q9HB58 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SP110Q9HB58 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SP110Q9HB58 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SP110Q9HB58 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SP110Q9HB58 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SP110Q9HB58 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SP110Q9HB58 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SP110Q9HB58 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SP110Q9HB58 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SP110Q9HB58 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SP110Q9HB58 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SP110Q9HB58 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SP110Q9HB58 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SP110Q9HB58 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SP110Q9HB58 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SP110Q9HB58 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SP110Q9HB58 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SP110Q9HB58 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SP110Q9HB58 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SP110Q9HB58 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SP110Q9HB58 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SP110Q9HB58 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SP110Q9HB58 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SP110Q9HB58 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SP110Q9HB58 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SP110Q9HB58 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SP110Q9HB58 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SP110Q9HB58 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SP110Q9HB58 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SP110Q9HB58 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SP110Q9HB58 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SP110Q9HB58 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SP110Q9HB58 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SP110Q9HB58 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SP110Q9HB58 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SP110Q9HB58 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SP110Q9HB58 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SP110Q9HB58 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SP110Q9HB58 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SP110Q9HB58 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SP110Q9HB58 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SP110Q9HB58 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SP110Q9HB58 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SP110Q9HB58 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SP110Q9HB58 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SP110Q9HB58 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SP110Q9HB58 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SP110Q9HB58 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SP110Q9HB58 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SP110Q9HB58 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SP110Q9HB58 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SP110Q9HB58 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SP110Q9HB58 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SP110Q9HB58 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SP110Q9HB58 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SP110Q9HB58 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SP110Q9HB58 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SP110Q9HB58 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SP110Q9HB58 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SP110Q9HB58 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SP110Q9HB58 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SP110Q9HB58 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SP110Q9HB58 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SP110Q9HB58 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.8 ms