Protein–RNA interactions for Protein: Q9HA38

ZMAT3, Zinc finger matrin-type protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMAT3Q9HA38 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZMAT3Q9HA38 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZMAT3Q9HA38 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZMAT3Q9HA38 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZMAT3Q9HA38 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZMAT3Q9HA38 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZMAT3Q9HA38 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZMAT3Q9HA38 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZMAT3Q9HA38 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZMAT3Q9HA38 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ZMAT3Q9HA38 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ZMAT3Q9HA38 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZMAT3Q9HA38 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZMAT3Q9HA38 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZMAT3Q9HA38 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZMAT3Q9HA38 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZMAT3Q9HA38 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZMAT3Q9HA38 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZMAT3Q9HA38 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ZMAT3Q9HA38 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZMAT3Q9HA38 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZMAT3Q9HA38 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ZMAT3Q9HA38 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZMAT3Q9HA38 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZMAT3Q9HA38 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZMAT3Q9HA38 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZMAT3Q9HA38 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZMAT3Q9HA38 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZMAT3Q9HA38 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ZMAT3Q9HA38 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZMAT3Q9HA38 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZMAT3Q9HA38 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZMAT3Q9HA38 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZMAT3Q9HA38 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZMAT3Q9HA38 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZMAT3Q9HA38 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZMAT3Q9HA38 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZMAT3Q9HA38 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZMAT3Q9HA38 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZMAT3Q9HA38 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZMAT3Q9HA38 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZMAT3Q9HA38 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZMAT3Q9HA38 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZMAT3Q9HA38 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZMAT3Q9HA38 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZMAT3Q9HA38 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZMAT3Q9HA38 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZMAT3Q9HA38 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZMAT3Q9HA38 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZMAT3Q9HA38 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZMAT3Q9HA38 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZMAT3Q9HA38 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZMAT3Q9HA38 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZMAT3Q9HA38 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZMAT3Q9HA38 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZMAT3Q9HA38 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ZMAT3Q9HA38 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZMAT3Q9HA38 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZMAT3Q9HA38 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZMAT3Q9HA38 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZMAT3Q9HA38 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZMAT3Q9HA38 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZMAT3Q9HA38 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZMAT3Q9HA38 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZMAT3Q9HA38 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZMAT3Q9HA38 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZMAT3Q9HA38 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZMAT3Q9HA38 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZMAT3Q9HA38 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZMAT3Q9HA38 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZMAT3Q9HA38 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZMAT3Q9HA38 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZMAT3Q9HA38 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZMAT3Q9HA38 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZMAT3Q9HA38 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZMAT3Q9HA38 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZMAT3Q9HA38 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZMAT3Q9HA38 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZMAT3Q9HA38 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZMAT3Q9HA38 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZMAT3Q9HA38 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZMAT3Q9HA38 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZMAT3Q9HA38 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZMAT3Q9HA38 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZMAT3Q9HA38 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZMAT3Q9HA38 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZMAT3Q9HA38 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZMAT3Q9HA38 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZMAT3Q9HA38 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZMAT3Q9HA38 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZMAT3Q9HA38 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ZMAT3Q9HA38 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZMAT3Q9HA38 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZMAT3Q9HA38 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZMAT3Q9HA38 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZMAT3Q9HA38 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZMAT3Q9HA38 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZMAT3Q9HA38 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZMAT3Q9HA38 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZMAT3Q9HA38 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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