Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Y6

POLR1B, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1BQ9H9Y6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR1BQ9H9Y6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR1BQ9H9Y6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR1BQ9H9Y6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR1BQ9H9Y6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR1BQ9H9Y6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR1BQ9H9Y6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR1BQ9H9Y6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR1BQ9H9Y6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR1BQ9H9Y6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR1BQ9H9Y6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR1BQ9H9Y6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR1BQ9H9Y6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR1BQ9H9Y6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR1BQ9H9Y6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR1BQ9H9Y6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR1BQ9H9Y6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR1BQ9H9Y6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR1BQ9H9Y6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR1BQ9H9Y6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR1BQ9H9Y6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR1BQ9H9Y6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR1BQ9H9Y6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR1BQ9H9Y6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR1BQ9H9Y6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR1BQ9H9Y6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR1BQ9H9Y6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR1BQ9H9Y6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR1BQ9H9Y6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR1BQ9H9Y6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR1BQ9H9Y6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR1BQ9H9Y6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
POLR1BQ9H9Y6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR1BQ9H9Y6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR1BQ9H9Y6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR1BQ9H9Y6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR1BQ9H9Y6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR1BQ9H9Y6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR1BQ9H9Y6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR1BQ9H9Y6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR1BQ9H9Y6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR1BQ9H9Y6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR1BQ9H9Y6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR1BQ9H9Y6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR1BQ9H9Y6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR1BQ9H9Y6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR1BQ9H9Y6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR1BQ9H9Y6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR1BQ9H9Y6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR1BQ9H9Y6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR1BQ9H9Y6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR1BQ9H9Y6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR1BQ9H9Y6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR1BQ9H9Y6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR1BQ9H9Y6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR1BQ9H9Y6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR1BQ9H9Y6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR1BQ9H9Y6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR1BQ9H9Y6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR1BQ9H9Y6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR1BQ9H9Y6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR1BQ9H9Y6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR1BQ9H9Y6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR1BQ9H9Y6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR1BQ9H9Y6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR1BQ9H9Y6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR1BQ9H9Y6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR1BQ9H9Y6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR1BQ9H9Y6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR1BQ9H9Y6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR1BQ9H9Y6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR1BQ9H9Y6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR1BQ9H9Y6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR1BQ9H9Y6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR1BQ9H9Y6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR1BQ9H9Y6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR1BQ9H9Y6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR1BQ9H9Y6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR1BQ9H9Y6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR1BQ9H9Y6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR1BQ9H9Y6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR1BQ9H9Y6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR1BQ9H9Y6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR1BQ9H9Y6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR1BQ9H9Y6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR1BQ9H9Y6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR1BQ9H9Y6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR1BQ9H9Y6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR1BQ9H9Y6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR1BQ9H9Y6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR1BQ9H9Y6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR1BQ9H9Y6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR1BQ9H9Y6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR1BQ9H9Y6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR1BQ9H9Y6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR1BQ9H9Y6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR1BQ9H9Y6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR1BQ9H9Y6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR1BQ9H9Y6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR1BQ9H9Y6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms