Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7L9

SUDS3, Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUDS3Q9H7L9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUDS3Q9H7L9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUDS3Q9H7L9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUDS3Q9H7L9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUDS3Q9H7L9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUDS3Q9H7L9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUDS3Q9H7L9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUDS3Q9H7L9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SUDS3Q9H7L9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SUDS3Q9H7L9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SUDS3Q9H7L9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SUDS3Q9H7L9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SUDS3Q9H7L9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SUDS3Q9H7L9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SUDS3Q9H7L9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SUDS3Q9H7L9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SUDS3Q9H7L9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SUDS3Q9H7L9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SUDS3Q9H7L9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SUDS3Q9H7L9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SUDS3Q9H7L9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SUDS3Q9H7L9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SUDS3Q9H7L9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SUDS3Q9H7L9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SUDS3Q9H7L9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SUDS3Q9H7L9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SUDS3Q9H7L9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SUDS3Q9H7L9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SUDS3Q9H7L9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SUDS3Q9H7L9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SUDS3Q9H7L9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SUDS3Q9H7L9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SUDS3Q9H7L9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SUDS3Q9H7L9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SUDS3Q9H7L9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SUDS3Q9H7L9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SUDS3Q9H7L9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SUDS3Q9H7L9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SUDS3Q9H7L9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SUDS3Q9H7L9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SUDS3Q9H7L9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SUDS3Q9H7L9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SUDS3Q9H7L9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SUDS3Q9H7L9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SUDS3Q9H7L9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SUDS3Q9H7L9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SUDS3Q9H7L9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SUDS3Q9H7L9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SUDS3Q9H7L9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SUDS3Q9H7L9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SUDS3Q9H7L9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SUDS3Q9H7L9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SUDS3Q9H7L9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SUDS3Q9H7L9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SUDS3Q9H7L9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SUDS3Q9H7L9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SUDS3Q9H7L9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SUDS3Q9H7L9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SUDS3Q9H7L9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SUDS3Q9H7L9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SUDS3Q9H7L9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SUDS3Q9H7L9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SUDS3Q9H7L9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SUDS3Q9H7L9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SUDS3Q9H7L9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SUDS3Q9H7L9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SUDS3Q9H7L9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SUDS3Q9H7L9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SUDS3Q9H7L9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SUDS3Q9H7L9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SUDS3Q9H7L9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SUDS3Q9H7L9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SUDS3Q9H7L9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SUDS3Q9H7L9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SUDS3Q9H7L9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SUDS3Q9H7L9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SUDS3Q9H7L9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SUDS3Q9H7L9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SUDS3Q9H7L9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SUDS3Q9H7L9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SUDS3Q9H7L9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SUDS3Q9H7L9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SUDS3Q9H7L9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SUDS3Q9H7L9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SUDS3Q9H7L9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SUDS3Q9H7L9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SUDS3Q9H7L9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SUDS3Q9H7L9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SUDS3Q9H7L9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SUDS3Q9H7L9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SUDS3Q9H7L9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SUDS3Q9H7L9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SUDS3Q9H7L9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SUDS3Q9H7L9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SUDS3Q9H7L9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SUDS3Q9H7L9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SUDS3Q9H7L9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SUDS3Q9H7L9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SUDS3Q9H7L9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SUDS3Q9H7L9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms