Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
SENP3Q9H4L4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
SENP3Q9H4L4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
SENP3Q9H4L4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
SENP3Q9H4L4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
SENP3Q9H4L4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
SENP3Q9H4L4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
SENP3Q9H4L4 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
SENP3Q9H4L4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
SENP3Q9H4L4 AC092068.1-201ENST00000592525 454 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
SENP3Q9H4L4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
SENP3Q9H4L4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
SENP3Q9H4L4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
SENP3Q9H4L4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
SENP3Q9H4L4 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
SENP3Q9H4L4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
SENP3Q9H4L4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
SENP3Q9H4L4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
SENP3Q9H4L4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
SENP3Q9H4L4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
SENP3Q9H4L4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
SENP3Q9H4L4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
SENP3Q9H4L4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
SENP3Q9H4L4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
SENP3Q9H4L4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
SENP3Q9H4L4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
SENP3Q9H4L4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
SENP3Q9H4L4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
SENP3Q9H4L4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
SENP3Q9H4L4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
SENP3Q9H4L4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
SENP3Q9H4L4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
SENP3Q9H4L4 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
SENP3Q9H4L4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
SENP3Q9H4L4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
SENP3Q9H4L4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
SENP3Q9H4L4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
SENP3Q9H4L4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
SENP3Q9H4L4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
SENP3Q9H4L4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
SENP3Q9H4L4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC36.18■■■■□ 3.38
SENP3Q9H4L4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
SENP3Q9H4L4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
SENP3Q9H4L4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
SENP3Q9H4L4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
SENP3Q9H4L4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
SENP3Q9H4L4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
SENP3Q9H4L4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
SENP3Q9H4L4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
SENP3Q9H4L4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
SENP3Q9H4L4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
SENP3Q9H4L4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
SENP3Q9H4L4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
SENP3Q9H4L4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
SENP3Q9H4L4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
SENP3Q9H4L4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
SENP3Q9H4L4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
SENP3Q9H4L4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
SENP3Q9H4L4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
SENP3Q9H4L4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
SENP3Q9H4L4 RN7SL275P-201ENST00000582762 335 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
SENP3Q9H4L4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
SENP3Q9H4L4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
SENP3Q9H4L4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
SENP3Q9H4L4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
SENP3Q9H4L4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
SENP3Q9H4L4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
SENP3Q9H4L4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
SENP3Q9H4L4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
SENP3Q9H4L4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
SENP3Q9H4L4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
SENP3Q9H4L4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
SENP3Q9H4L4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC36.07■■■■□ 3.37
SENP3Q9H4L4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
SENP3Q9H4L4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
SENP3Q9H4L4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
SENP3Q9H4L4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
SENP3Q9H4L4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
SENP3Q9H4L4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
SENP3Q9H4L4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
SENP3Q9H4L4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
SENP3Q9H4L4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC36.05■■■■□ 3.36
SENP3Q9H4L4 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
SENP3Q9H4L4 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
SENP3Q9H4L4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
SENP3Q9H4L4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
SENP3Q9H4L4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
SENP3Q9H4L4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
SENP3Q9H4L4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
SENP3Q9H4L4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
SENP3Q9H4L4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
SENP3Q9H4L4 TMEM14EP-202ENST00000639378 1296 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
SENP3Q9H4L4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
SENP3Q9H4L4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
SENP3Q9H4L4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
SENP3Q9H4L4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
SENP3Q9H4L4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
SENP3Q9H4L4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
SENP3Q9H4L4 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC36■■■■□ 3.35
SENP3Q9H4L4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC36■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms