Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3P2

NELFA, Negative elongation factor A, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFAQ9H3P2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NELFAQ9H3P2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NELFAQ9H3P2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NELFAQ9H3P2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NELFAQ9H3P2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NELFAQ9H3P2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NELFAQ9H3P2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NELFAQ9H3P2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NELFAQ9H3P2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NELFAQ9H3P2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NELFAQ9H3P2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NELFAQ9H3P2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NELFAQ9H3P2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NELFAQ9H3P2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NELFAQ9H3P2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NELFAQ9H3P2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NELFAQ9H3P2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NELFAQ9H3P2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NELFAQ9H3P2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NELFAQ9H3P2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NELFAQ9H3P2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NELFAQ9H3P2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NELFAQ9H3P2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NELFAQ9H3P2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NELFAQ9H3P2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NELFAQ9H3P2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NELFAQ9H3P2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NELFAQ9H3P2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NELFAQ9H3P2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NELFAQ9H3P2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NELFAQ9H3P2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NELFAQ9H3P2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NELFAQ9H3P2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NELFAQ9H3P2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NELFAQ9H3P2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NELFAQ9H3P2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NELFAQ9H3P2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NELFAQ9H3P2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NELFAQ9H3P2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NELFAQ9H3P2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NELFAQ9H3P2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NELFAQ9H3P2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NELFAQ9H3P2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NELFAQ9H3P2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NELFAQ9H3P2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NELFAQ9H3P2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NELFAQ9H3P2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NELFAQ9H3P2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NELFAQ9H3P2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NELFAQ9H3P2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NELFAQ9H3P2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NELFAQ9H3P2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NELFAQ9H3P2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NELFAQ9H3P2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NELFAQ9H3P2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NELFAQ9H3P2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NELFAQ9H3P2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NELFAQ9H3P2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NELFAQ9H3P2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NELFAQ9H3P2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NELFAQ9H3P2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NELFAQ9H3P2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NELFAQ9H3P2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NELFAQ9H3P2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NELFAQ9H3P2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NELFAQ9H3P2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NELFAQ9H3P2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NELFAQ9H3P2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NELFAQ9H3P2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NELFAQ9H3P2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NELFAQ9H3P2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NELFAQ9H3P2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NELFAQ9H3P2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NELFAQ9H3P2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NELFAQ9H3P2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NELFAQ9H3P2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NELFAQ9H3P2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NELFAQ9H3P2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NELFAQ9H3P2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NELFAQ9H3P2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NELFAQ9H3P2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NELFAQ9H3P2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NELFAQ9H3P2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NELFAQ9H3P2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NELFAQ9H3P2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NELFAQ9H3P2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NELFAQ9H3P2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NELFAQ9H3P2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NELFAQ9H3P2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NELFAQ9H3P2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NELFAQ9H3P2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NELFAQ9H3P2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NELFAQ9H3P2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NELFAQ9H3P2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NELFAQ9H3P2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NELFAQ9H3P2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NELFAQ9H3P2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NELFAQ9H3P2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NELFAQ9H3P2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NELFAQ9H3P2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms