Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LINC00597Q9H2U6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LINC00597Q9H2U6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LINC00597Q9H2U6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LINC00597Q9H2U6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LINC00597Q9H2U6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LINC00597Q9H2U6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LINC00597Q9H2U6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LINC00597Q9H2U6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LINC00597Q9H2U6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LINC00597Q9H2U6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LINC00597Q9H2U6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LINC00597Q9H2U6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LINC00597Q9H2U6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
LINC00597Q9H2U6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LINC00597Q9H2U6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LINC00597Q9H2U6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
LINC00597Q9H2U6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LINC00597Q9H2U6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
LINC00597Q9H2U6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LINC00597Q9H2U6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LINC00597Q9H2U6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LINC00597Q9H2U6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LINC00597Q9H2U6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LINC00597Q9H2U6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LINC00597Q9H2U6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LINC00597Q9H2U6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LINC00597Q9H2U6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LINC00597Q9H2U6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LINC00597Q9H2U6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LINC00597Q9H2U6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LINC00597Q9H2U6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LINC00597Q9H2U6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LINC00597Q9H2U6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LINC00597Q9H2U6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
LINC00597Q9H2U6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LINC00597Q9H2U6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LINC00597Q9H2U6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LINC00597Q9H2U6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LINC00597Q9H2U6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LINC00597Q9H2U6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LINC00597Q9H2U6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
LINC00597Q9H2U6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
LINC00597Q9H2U6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LINC00597Q9H2U6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LINC00597Q9H2U6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LINC00597Q9H2U6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LINC00597Q9H2U6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LINC00597Q9H2U6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LINC00597Q9H2U6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LINC00597Q9H2U6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LINC00597Q9H2U6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LINC00597Q9H2U6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LINC00597Q9H2U6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LINC00597Q9H2U6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LINC00597Q9H2U6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LINC00597Q9H2U6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LINC00597Q9H2U6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LINC00597Q9H2U6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LINC00597Q9H2U6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LINC00597Q9H2U6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LINC00597Q9H2U6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LINC00597Q9H2U6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LINC00597Q9H2U6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LINC00597Q9H2U6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LINC00597Q9H2U6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LINC00597Q9H2U6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LINC00597Q9H2U6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LINC00597Q9H2U6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LINC00597Q9H2U6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LINC00597Q9H2U6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LINC00597Q9H2U6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LINC00597Q9H2U6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
LINC00597Q9H2U6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
LINC00597Q9H2U6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
LINC00597Q9H2U6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LINC00597Q9H2U6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LINC00597Q9H2U6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LINC00597Q9H2U6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LINC00597Q9H2U6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LINC00597Q9H2U6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LINC00597Q9H2U6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
LINC00597Q9H2U6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
LINC00597Q9H2U6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LINC00597Q9H2U6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LINC00597Q9H2U6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LINC00597Q9H2U6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LINC00597Q9H2U6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LINC00597Q9H2U6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LINC00597Q9H2U6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LINC00597Q9H2U6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LINC00597Q9H2U6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LINC00597Q9H2U6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
LINC00597Q9H2U6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LINC00597Q9H2U6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LINC00597Q9H2U6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LINC00597Q9H2U6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LINC00597Q9H2U6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LINC00597Q9H2U6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LINC00597Q9H2U6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms