Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2D6

TRIOBP, TRIO and F-actin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBPQ9H2D6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIOBPQ9H2D6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIOBPQ9H2D6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TRIOBPQ9H2D6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIOBPQ9H2D6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIOBPQ9H2D6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIOBPQ9H2D6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIOBPQ9H2D6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIOBPQ9H2D6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TRIOBPQ9H2D6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TRIOBPQ9H2D6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TRIOBPQ9H2D6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TRIOBPQ9H2D6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TRIOBPQ9H2D6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIOBPQ9H2D6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIOBPQ9H2D6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIOBPQ9H2D6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIOBPQ9H2D6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TRIOBPQ9H2D6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TRIOBPQ9H2D6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TRIOBPQ9H2D6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRIOBPQ9H2D6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TRIOBPQ9H2D6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TRIOBPQ9H2D6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TRIOBPQ9H2D6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRIOBPQ9H2D6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TRIOBPQ9H2D6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TRIOBPQ9H2D6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRIOBPQ9H2D6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRIOBPQ9H2D6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIOBPQ9H2D6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIOBPQ9H2D6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIOBPQ9H2D6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIOBPQ9H2D6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIOBPQ9H2D6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIOBPQ9H2D6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIOBPQ9H2D6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIOBPQ9H2D6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIOBPQ9H2D6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIOBPQ9H2D6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIOBPQ9H2D6 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIOBPQ9H2D6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIOBPQ9H2D6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIOBPQ9H2D6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIOBPQ9H2D6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIOBPQ9H2D6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIOBPQ9H2D6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIOBPQ9H2D6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIOBPQ9H2D6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIOBPQ9H2D6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIOBPQ9H2D6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIOBPQ9H2D6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIOBPQ9H2D6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIOBPQ9H2D6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIOBPQ9H2D6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIOBPQ9H2D6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIOBPQ9H2D6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIOBPQ9H2D6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TRIOBPQ9H2D6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIOBPQ9H2D6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIOBPQ9H2D6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIOBPQ9H2D6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIOBPQ9H2D6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIOBPQ9H2D6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIOBPQ9H2D6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIOBPQ9H2D6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIOBPQ9H2D6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIOBPQ9H2D6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIOBPQ9H2D6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIOBPQ9H2D6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIOBPQ9H2D6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIOBPQ9H2D6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIOBPQ9H2D6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIOBPQ9H2D6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIOBPQ9H2D6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIOBPQ9H2D6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIOBPQ9H2D6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIOBPQ9H2D6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIOBPQ9H2D6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
TRIOBPQ9H2D6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIOBPQ9H2D6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIOBPQ9H2D6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIOBPQ9H2D6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIOBPQ9H2D6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIOBPQ9H2D6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIOBPQ9H2D6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIOBPQ9H2D6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIOBPQ9H2D6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIOBPQ9H2D6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIOBPQ9H2D6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIOBPQ9H2D6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIOBPQ9H2D6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIOBPQ9H2D6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIOBPQ9H2D6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIOBPQ9H2D6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIOBPQ9H2D6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIOBPQ9H2D6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIOBPQ9H2D6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIOBPQ9H2D6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIOBPQ9H2D6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms