Protein–RNA interactions for Protein: Q9H175

CSRNP2, Cysteine/serine-rich nuclear protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP2Q9H175 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CSRNP2Q9H175 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CSRNP2Q9H175 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CSRNP2Q9H175 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CSRNP2Q9H175 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CSRNP2Q9H175 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CSRNP2Q9H175 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CSRNP2Q9H175 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CSRNP2Q9H175 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CSRNP2Q9H175 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CSRNP2Q9H175 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CSRNP2Q9H175 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CSRNP2Q9H175 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CSRNP2Q9H175 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CSRNP2Q9H175 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CSRNP2Q9H175 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CSRNP2Q9H175 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CSRNP2Q9H175 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CSRNP2Q9H175 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CSRNP2Q9H175 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CSRNP2Q9H175 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CSRNP2Q9H175 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CSRNP2Q9H175 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CSRNP2Q9H175 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CSRNP2Q9H175 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CSRNP2Q9H175 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CSRNP2Q9H175 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CSRNP2Q9H175 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CSRNP2Q9H175 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CSRNP2Q9H175 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CSRNP2Q9H175 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CSRNP2Q9H175 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CSRNP2Q9H175 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CSRNP2Q9H175 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
CSRNP2Q9H175 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CSRNP2Q9H175 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CSRNP2Q9H175 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CSRNP2Q9H175 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CSRNP2Q9H175 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CSRNP2Q9H175 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CSRNP2Q9H175 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CSRNP2Q9H175 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CSRNP2Q9H175 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CSRNP2Q9H175 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CSRNP2Q9H175 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CSRNP2Q9H175 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CSRNP2Q9H175 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CSRNP2Q9H175 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CSRNP2Q9H175 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CSRNP2Q9H175 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CSRNP2Q9H175 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CSRNP2Q9H175 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CSRNP2Q9H175 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CSRNP2Q9H175 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CSRNP2Q9H175 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CSRNP2Q9H175 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CSRNP2Q9H175 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CSRNP2Q9H175 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CSRNP2Q9H175 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CSRNP2Q9H175 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CSRNP2Q9H175 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CSRNP2Q9H175 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CSRNP2Q9H175 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CSRNP2Q9H175 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CSRNP2Q9H175 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CSRNP2Q9H175 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CSRNP2Q9H175 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CSRNP2Q9H175 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CSRNP2Q9H175 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CSRNP2Q9H175 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CSRNP2Q9H175 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CSRNP2Q9H175 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CSRNP2Q9H175 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CSRNP2Q9H175 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CSRNP2Q9H175 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CSRNP2Q9H175 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CSRNP2Q9H175 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CSRNP2Q9H175 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CSRNP2Q9H175 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CSRNP2Q9H175 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CSRNP2Q9H175 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CSRNP2Q9H175 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CSRNP2Q9H175 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CSRNP2Q9H175 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CSRNP2Q9H175 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CSRNP2Q9H175 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CSRNP2Q9H175 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CSRNP2Q9H175 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CSRNP2Q9H175 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CSRNP2Q9H175 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CSRNP2Q9H175 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CSRNP2Q9H175 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CSRNP2Q9H175 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CSRNP2Q9H175 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CSRNP2Q9H175 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CSRNP2Q9H175 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CSRNP2Q9H175 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CSRNP2Q9H175 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CSRNP2Q9H175 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CSRNP2Q9H175 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms