Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0Q0

FAM49A, Protein FAM49A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM49AQ9H0Q0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FAM49AQ9H0Q0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FAM49AQ9H0Q0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FAM49AQ9H0Q0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FAM49AQ9H0Q0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FAM49AQ9H0Q0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FAM49AQ9H0Q0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FAM49AQ9H0Q0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FAM49AQ9H0Q0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FAM49AQ9H0Q0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FAM49AQ9H0Q0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FAM49AQ9H0Q0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FAM49AQ9H0Q0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FAM49AQ9H0Q0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FAM49AQ9H0Q0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
FAM49AQ9H0Q0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
FAM49AQ9H0Q0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FAM49AQ9H0Q0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FAM49AQ9H0Q0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FAM49AQ9H0Q0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FAM49AQ9H0Q0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FAM49AQ9H0Q0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FAM49AQ9H0Q0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FAM49AQ9H0Q0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FAM49AQ9H0Q0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FAM49AQ9H0Q0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FAM49AQ9H0Q0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
FAM49AQ9H0Q0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FAM49AQ9H0Q0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
FAM49AQ9H0Q0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FAM49AQ9H0Q0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FAM49AQ9H0Q0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FAM49AQ9H0Q0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FAM49AQ9H0Q0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FAM49AQ9H0Q0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FAM49AQ9H0Q0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
FAM49AQ9H0Q0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FAM49AQ9H0Q0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FAM49AQ9H0Q0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FAM49AQ9H0Q0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FAM49AQ9H0Q0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
FAM49AQ9H0Q0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FAM49AQ9H0Q0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.57■■■□□ 2
FAM49AQ9H0Q0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FAM49AQ9H0Q0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
FAM49AQ9H0Q0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
FAM49AQ9H0Q0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
FAM49AQ9H0Q0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
FAM49AQ9H0Q0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
FAM49AQ9H0Q0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.56■■■□□ 2
FAM49AQ9H0Q0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FAM49AQ9H0Q0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FAM49AQ9H0Q0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FAM49AQ9H0Q0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FAM49AQ9H0Q0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
FAM49AQ9H0Q0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FAM49AQ9H0Q0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FAM49AQ9H0Q0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FAM49AQ9H0Q0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.55■■■□□ 2
FAM49AQ9H0Q0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FAM49AQ9H0Q0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FAM49AQ9H0Q0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FAM49AQ9H0Q0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FAM49AQ9H0Q0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
FAM49AQ9H0Q0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.54■■■□□ 2
FAM49AQ9H0Q0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FAM49AQ9H0Q0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FAM49AQ9H0Q0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
FAM49AQ9H0Q0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
FAM49AQ9H0Q0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
FAM49AQ9H0Q0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FAM49AQ9H0Q0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
FAM49AQ9H0Q0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FAM49AQ9H0Q0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FAM49AQ9H0Q0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
FAM49AQ9H0Q0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.52■■■□□ 2
FAM49AQ9H0Q0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FAM49AQ9H0Q0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FAM49AQ9H0Q0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FAM49AQ9H0Q0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FAM49AQ9H0Q0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FAM49AQ9H0Q0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FAM49AQ9H0Q0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FAM49AQ9H0Q0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FAM49AQ9H0Q0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FAM49AQ9H0Q0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
FAM49AQ9H0Q0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FAM49AQ9H0Q0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FAM49AQ9H0Q0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FAM49AQ9H0Q0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FAM49AQ9H0Q0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
FAM49AQ9H0Q0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FAM49AQ9H0Q0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FAM49AQ9H0Q0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
FAM49AQ9H0Q0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FAM49AQ9H0Q0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FAM49AQ9H0Q0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FAM49AQ9H0Q0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
FAM49AQ9H0Q0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FAM49AQ9H0Q0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms