Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0I3

CCDC113, Coiled-coil domain-containing protein 113, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC113Q9H0I3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC113Q9H0I3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC113Q9H0I3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC113Q9H0I3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC113Q9H0I3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC113Q9H0I3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC113Q9H0I3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC113Q9H0I3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC113Q9H0I3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CCDC113Q9H0I3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC113Q9H0I3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC113Q9H0I3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC113Q9H0I3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC113Q9H0I3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC113Q9H0I3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC113Q9H0I3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC113Q9H0I3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC113Q9H0I3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC113Q9H0I3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC113Q9H0I3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC113Q9H0I3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC113Q9H0I3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC113Q9H0I3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC113Q9H0I3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC113Q9H0I3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC113Q9H0I3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CCDC113Q9H0I3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC113Q9H0I3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CCDC113Q9H0I3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC113Q9H0I3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC113Q9H0I3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC113Q9H0I3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC113Q9H0I3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC113Q9H0I3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC113Q9H0I3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC113Q9H0I3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC113Q9H0I3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC113Q9H0I3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC113Q9H0I3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC113Q9H0I3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC113Q9H0I3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC113Q9H0I3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC113Q9H0I3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC113Q9H0I3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC113Q9H0I3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC113Q9H0I3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC113Q9H0I3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC113Q9H0I3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC113Q9H0I3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC113Q9H0I3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC113Q9H0I3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC113Q9H0I3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC113Q9H0I3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC113Q9H0I3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC113Q9H0I3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC113Q9H0I3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC113Q9H0I3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC113Q9H0I3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC113Q9H0I3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC113Q9H0I3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC113Q9H0I3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC113Q9H0I3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC113Q9H0I3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC113Q9H0I3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC113Q9H0I3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC113Q9H0I3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC113Q9H0I3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC113Q9H0I3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC113Q9H0I3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC113Q9H0I3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC113Q9H0I3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC113Q9H0I3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC113Q9H0I3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC113Q9H0I3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC113Q9H0I3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC113Q9H0I3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC113Q9H0I3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC113Q9H0I3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC113Q9H0I3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC113Q9H0I3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC113Q9H0I3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC113Q9H0I3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC113Q9H0I3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC113Q9H0I3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC113Q9H0I3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC113Q9H0I3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC113Q9H0I3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC113Q9H0I3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC113Q9H0I3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC113Q9H0I3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC113Q9H0I3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC113Q9H0I3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC113Q9H0I3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC113Q9H0I3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC113Q9H0I3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC113Q9H0I3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC113Q9H0I3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC113Q9H0I3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC113Q9H0I3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC113Q9H0I3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms