Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR1EQ9GZS1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR1EQ9GZS1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR1EQ9GZS1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR1EQ9GZS1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR1EQ9GZS1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR1EQ9GZS1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR1EQ9GZS1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR1EQ9GZS1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR1EQ9GZS1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR1EQ9GZS1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR1EQ9GZS1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR1EQ9GZS1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR1EQ9GZS1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR1EQ9GZS1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR1EQ9GZS1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR1EQ9GZS1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR1EQ9GZS1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR1EQ9GZS1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR1EQ9GZS1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
POLR1EQ9GZS1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
POLR1EQ9GZS1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR1EQ9GZS1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR1EQ9GZS1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR1EQ9GZS1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR1EQ9GZS1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR1EQ9GZS1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR1EQ9GZS1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR1EQ9GZS1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR1EQ9GZS1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR1EQ9GZS1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR1EQ9GZS1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR1EQ9GZS1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR1EQ9GZS1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR1EQ9GZS1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR1EQ9GZS1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR1EQ9GZS1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR1EQ9GZS1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR1EQ9GZS1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR1EQ9GZS1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR1EQ9GZS1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR1EQ9GZS1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR1EQ9GZS1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR1EQ9GZS1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR1EQ9GZS1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR1EQ9GZS1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR1EQ9GZS1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR1EQ9GZS1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR1EQ9GZS1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR1EQ9GZS1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR1EQ9GZS1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR1EQ9GZS1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR1EQ9GZS1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR1EQ9GZS1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR1EQ9GZS1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR1EQ9GZS1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR1EQ9GZS1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR1EQ9GZS1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR1EQ9GZS1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR1EQ9GZS1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR1EQ9GZS1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR1EQ9GZS1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR1EQ9GZS1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR1EQ9GZS1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR1EQ9GZS1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR1EQ9GZS1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR1EQ9GZS1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR1EQ9GZS1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR1EQ9GZS1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR1EQ9GZS1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR1EQ9GZS1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR1EQ9GZS1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR1EQ9GZS1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR1EQ9GZS1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR1EQ9GZS1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR1EQ9GZS1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR1EQ9GZS1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR1EQ9GZS1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR1EQ9GZS1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR1EQ9GZS1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR1EQ9GZS1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR1EQ9GZS1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR1EQ9GZS1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR1EQ9GZS1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR1EQ9GZS1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
POLR1EQ9GZS1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR1EQ9GZS1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR1EQ9GZS1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR1EQ9GZS1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR1EQ9GZS1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR1EQ9GZS1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR1EQ9GZS1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR1EQ9GZS1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR1EQ9GZS1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR1EQ9GZS1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR1EQ9GZS1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR1EQ9GZS1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR1EQ9GZS1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR1EQ9GZS1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR1EQ9GZS1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms