Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESU6

Brd4, Bromodomain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd4Q9ESU6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC40.21■■■■■ 4.03
Brd4Q9ESU6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
Brd4Q9ESU6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC40.21■■■■■ 4.03
Brd4Q9ESU6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC40.2■■■■■ 4.03
Brd4Q9ESU6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC40.2■■■■■ 4.03
Brd4Q9ESU6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
Brd4Q9ESU6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC40.2■■■■■ 4.03
Brd4Q9ESU6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC40.2■■■■■ 4.03
Brd4Q9ESU6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC40.19■■■■■ 4.02
Brd4Q9ESU6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
Brd4Q9ESU6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC40.17■■■■■ 4.02
Brd4Q9ESU6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
Brd4Q9ESU6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
Brd4Q9ESU6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
Brd4Q9ESU6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
Brd4Q9ESU6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
Brd4Q9ESU6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
Brd4Q9ESU6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
Brd4Q9ESU6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
Brd4Q9ESU6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
Brd4Q9ESU6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC40.15■■■■■ 4.02
Brd4Q9ESU6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
Brd4Q9ESU6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
Brd4Q9ESU6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
Brd4Q9ESU6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.01
Brd4Q9ESU6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
Brd4Q9ESU6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
Brd4Q9ESU6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC40.11■■■■■ 4.01
Brd4Q9ESU6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
Brd4Q9ESU6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
Brd4Q9ESU6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC40.1■■■■■ 4.01
Brd4Q9ESU6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC40.1■■■■■ 4.01
Brd4Q9ESU6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
Brd4Q9ESU6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
Brd4Q9ESU6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
Brd4Q9ESU6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
Brd4Q9ESU6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
Brd4Q9ESU6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
Brd4Q9ESU6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
Brd4Q9ESU6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
Brd4Q9ESU6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC40.06■■■■■ 4
Brd4Q9ESU6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC40.06■■■■■ 4
Brd4Q9ESU6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
Brd4Q9ESU6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
Brd4Q9ESU6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.03■■■■■ 4
Brd4Q9ESU6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.02■■■■■ 4
Brd4Q9ESU6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
Brd4Q9ESU6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.01■■■■■ 4
Brd4Q9ESU6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Brd4Q9ESU6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Brd4Q9ESU6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Brd4Q9ESU6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC39.99■■■■□ 3.99
Brd4Q9ESU6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC39.99■■■■□ 3.99
Brd4Q9ESU6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.99■■■■□ 3.99
Brd4Q9ESU6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
Brd4Q9ESU6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
Brd4Q9ESU6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC39.97■■■■□ 3.99
Brd4Q9ESU6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
Brd4Q9ESU6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.95■■■■□ 3.99
Brd4Q9ESU6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
Brd4Q9ESU6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC39.93■■■■□ 3.98
Brd4Q9ESU6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC39.93■■■■□ 3.98
Brd4Q9ESU6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC39.93■■■■□ 3.98
Brd4Q9ESU6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
Brd4Q9ESU6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
Brd4Q9ESU6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.91■■■■□ 3.98
Brd4Q9ESU6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
Brd4Q9ESU6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC39.89■■■■□ 3.98
Brd4Q9ESU6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC39.88■■■■□ 3.97
Brd4Q9ESU6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
Brd4Q9ESU6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
Brd4Q9ESU6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.84■■■■□ 3.97
Brd4Q9ESU6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC39.84■■■■□ 3.97
Brd4Q9ESU6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC39.84■■■■□ 3.97
Brd4Q9ESU6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC39.84■■■■□ 3.97
Brd4Q9ESU6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC39.84■■■■□ 3.97
Brd4Q9ESU6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC39.83■■■■□ 3.97
Brd4Q9ESU6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
Brd4Q9ESU6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
Brd4Q9ESU6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.82■■■■□ 3.97
Brd4Q9ESU6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC39.82■■■■□ 3.96
Brd4Q9ESU6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
Brd4Q9ESU6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC39.8■■■■□ 3.96
Brd4Q9ESU6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
Brd4Q9ESU6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC39.79■■■■□ 3.96
Brd4Q9ESU6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC39.78■■■■□ 3.96
Brd4Q9ESU6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
Brd4Q9ESU6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
Brd4Q9ESU6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC39.77■■■■□ 3.96
Brd4Q9ESU6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC39.76■■■■□ 3.96
Brd4Q9ESU6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
Brd4Q9ESU6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC39.76■■■■□ 3.96
Brd4Q9ESU6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.95
Brd4Q9ESU6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
Brd4Q9ESU6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
Brd4Q9ESU6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.74■■■■□ 3.95
Brd4Q9ESU6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
Brd4Q9ESU6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
Brd4Q9ESU6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC39.73■■■■□ 3.95
Brd4Q9ESU6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms