Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA6

Tfip11, Tuftelin-interacting protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfip11Q9ERA6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tfip11Q9ERA6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tfip11Q9ERA6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tfip11Q9ERA6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tfip11Q9ERA6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tfip11Q9ERA6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tfip11Q9ERA6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Tfip11Q9ERA6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tfip11Q9ERA6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tfip11Q9ERA6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tfip11Q9ERA6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tfip11Q9ERA6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tfip11Q9ERA6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tfip11Q9ERA6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tfip11Q9ERA6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tfip11Q9ERA6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tfip11Q9ERA6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tfip11Q9ERA6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tfip11Q9ERA6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tfip11Q9ERA6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tfip11Q9ERA6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tfip11Q9ERA6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tfip11Q9ERA6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Tfip11Q9ERA6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tfip11Q9ERA6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tfip11Q9ERA6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tfip11Q9ERA6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tfip11Q9ERA6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tfip11Q9ERA6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tfip11Q9ERA6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tfip11Q9ERA6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Tfip11Q9ERA6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tfip11Q9ERA6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tfip11Q9ERA6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tfip11Q9ERA6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tfip11Q9ERA6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Tfip11Q9ERA6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tfip11Q9ERA6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Tfip11Q9ERA6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tfip11Q9ERA6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tfip11Q9ERA6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tfip11Q9ERA6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tfip11Q9ERA6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Tfip11Q9ERA6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tfip11Q9ERA6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tfip11Q9ERA6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tfip11Q9ERA6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tfip11Q9ERA6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Tfip11Q9ERA6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tfip11Q9ERA6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Tfip11Q9ERA6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tfip11Q9ERA6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Tfip11Q9ERA6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Tfip11Q9ERA6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tfip11Q9ERA6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tfip11Q9ERA6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tfip11Q9ERA6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tfip11Q9ERA6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tfip11Q9ERA6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tfip11Q9ERA6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tfip11Q9ERA6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tfip11Q9ERA6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tfip11Q9ERA6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tfip11Q9ERA6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Tfip11Q9ERA6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tfip11Q9ERA6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tfip11Q9ERA6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tfip11Q9ERA6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tfip11Q9ERA6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tfip11Q9ERA6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tfip11Q9ERA6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tfip11Q9ERA6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tfip11Q9ERA6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tfip11Q9ERA6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tfip11Q9ERA6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tfip11Q9ERA6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Tfip11Q9ERA6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tfip11Q9ERA6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tfip11Q9ERA6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tfip11Q9ERA6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tfip11Q9ERA6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tfip11Q9ERA6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tfip11Q9ERA6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Tfip11Q9ERA6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tfip11Q9ERA6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tfip11Q9ERA6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tfip11Q9ERA6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tfip11Q9ERA6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tfip11Q9ERA6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tfip11Q9ERA6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tfip11Q9ERA6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tfip11Q9ERA6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tfip11Q9ERA6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tfip11Q9ERA6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tfip11Q9ERA6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tfip11Q9ERA6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tfip11Q9ERA6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tfip11Q9ERA6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Tfip11Q9ERA6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tfip11Q9ERA6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms