Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Dap3Q9ER88 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Dap3Q9ER88 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Dap3Q9ER88 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Dap3Q9ER88 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Dap3Q9ER88 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Dap3Q9ER88 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Dap3Q9ER88 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Dap3Q9ER88 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dap3Q9ER88 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dap3Q9ER88 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Dap3Q9ER88 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Dap3Q9ER88 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Dap3Q9ER88 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Dap3Q9ER88 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Dap3Q9ER88 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Dap3Q9ER88 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dap3Q9ER88 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Dap3Q9ER88 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Dap3Q9ER88 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Dap3Q9ER88 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Dap3Q9ER88 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Dap3Q9ER88 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Dap3Q9ER88 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Dap3Q9ER88 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Dap3Q9ER88 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Dap3Q9ER88 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Dap3Q9ER88 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Dap3Q9ER88 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Dap3Q9ER88 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Dap3Q9ER88 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Dap3Q9ER88 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Dap3Q9ER88 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Dap3Q9ER88 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Dap3Q9ER88 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Dap3Q9ER88 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Dap3Q9ER88 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Dap3Q9ER88 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Dap3Q9ER88 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Dap3Q9ER88 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Dap3Q9ER88 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Dap3Q9ER88 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Dap3Q9ER88 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Dap3Q9ER88 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Dap3Q9ER88 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Dap3Q9ER88 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Dap3Q9ER88 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Dap3Q9ER88 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Dap3Q9ER88 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Dap3Q9ER88 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Dap3Q9ER88 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Dap3Q9ER88 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Dap3Q9ER88 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Dap3Q9ER88 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Dap3Q9ER88 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Dap3Q9ER88 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Dap3Q9ER88 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Dap3Q9ER88 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Dap3Q9ER88 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Dap3Q9ER88 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Dap3Q9ER88 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Dap3Q9ER88 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Dap3Q9ER88 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Dap3Q9ER88 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Dap3Q9ER88 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Dap3Q9ER88 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Dap3Q9ER88 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Dap3Q9ER88 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Dap3Q9ER88 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Dap3Q9ER88 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Dap3Q9ER88 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Dap3Q9ER88 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Dap3Q9ER88 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Dap3Q9ER88 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Dap3Q9ER88 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Dap3Q9ER88 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Dap3Q9ER88 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Dap3Q9ER88 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Dap3Q9ER88 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Dap3Q9ER88 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Dap3Q9ER88 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Dap3Q9ER88 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Dap3Q9ER88 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Dap3Q9ER88 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Dap3Q9ER88 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Dap3Q9ER88 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Dap3Q9ER88 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Dap3Q9ER88 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Dap3Q9ER88 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Dap3Q9ER88 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dap3Q9ER88 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dap3Q9ER88 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dap3Q9ER88 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dap3Q9ER88 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Dap3Q9ER88 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dap3Q9ER88 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dap3Q9ER88 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dap3Q9ER88 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dap3Q9ER88 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dap3Q9ER88 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms