Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stx12Q9ER00 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stx12Q9ER00 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx12Q9ER00 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx12Q9ER00 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx12Q9ER00 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx12Q9ER00 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx12Q9ER00 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx12Q9ER00 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx12Q9ER00 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx12Q9ER00 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx12Q9ER00 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx12Q9ER00 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx12Q9ER00 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx12Q9ER00 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx12Q9ER00 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx12Q9ER00 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx12Q9ER00 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx12Q9ER00 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx12Q9ER00 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx12Q9ER00 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx12Q9ER00 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx12Q9ER00 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stx12Q9ER00 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stx12Q9ER00 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stx12Q9ER00 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stx12Q9ER00 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stx12Q9ER00 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stx12Q9ER00 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stx12Q9ER00 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stx12Q9ER00 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx12Q9ER00 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx12Q9ER00 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx12Q9ER00 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx12Q9ER00 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx12Q9ER00 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx12Q9ER00 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx12Q9ER00 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx12Q9ER00 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx12Q9ER00 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx12Q9ER00 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx12Q9ER00 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx12Q9ER00 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx12Q9ER00 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stx12Q9ER00 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stx12Q9ER00 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stx12Q9ER00 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Stx12Q9ER00 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stx12Q9ER00 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Stx12Q9ER00 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stx12Q9ER00 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Stx12Q9ER00 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stx12Q9ER00 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stx12Q9ER00 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stx12Q9ER00 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stx12Q9ER00 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stx12Q9ER00 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stx12Q9ER00 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stx12Q9ER00 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stx12Q9ER00 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stx12Q9ER00 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stx12Q9ER00 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stx12Q9ER00 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stx12Q9ER00 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stx12Q9ER00 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stx12Q9ER00 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stx12Q9ER00 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stx12Q9ER00 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stx12Q9ER00 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stx12Q9ER00 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stx12Q9ER00 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stx12Q9ER00 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stx12Q9ER00 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stx12Q9ER00 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stx12Q9ER00 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stx12Q9ER00 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stx12Q9ER00 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stx12Q9ER00 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Stx12Q9ER00 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stx12Q9ER00 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stx12Q9ER00 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stx12Q9ER00 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stx12Q9ER00 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stx12Q9ER00 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stx12Q9ER00 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stx12Q9ER00 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stx12Q9ER00 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stx12Q9ER00 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stx12Q9ER00 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stx12Q9ER00 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stx12Q9ER00 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stx12Q9ER00 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stx12Q9ER00 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stx12Q9ER00 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stx12Q9ER00 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stx12Q9ER00 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stx12Q9ER00 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stx12Q9ER00 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stx12Q9ER00 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stx12Q9ER00 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 199.8 ms