Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQC0

Chst1, Carbohydrate sulfotransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chst1Q9EQC0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Chst1Q9EQC0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Chst1Q9EQC0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Chst1Q9EQC0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Chst1Q9EQC0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Chst1Q9EQC0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Chst1Q9EQC0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Chst1Q9EQC0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Chst1Q9EQC0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Chst1Q9EQC0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Chst1Q9EQC0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Chst1Q9EQC0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Chst1Q9EQC0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Chst1Q9EQC0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Chst1Q9EQC0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Chst1Q9EQC0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Chst1Q9EQC0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Chst1Q9EQC0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Chst1Q9EQC0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Chst1Q9EQC0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Chst1Q9EQC0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Chst1Q9EQC0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Chst1Q9EQC0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chst1Q9EQC0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chst1Q9EQC0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chst1Q9EQC0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chst1Q9EQC0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chst1Q9EQC0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chst1Q9EQC0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chst1Q9EQC0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chst1Q9EQC0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chst1Q9EQC0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chst1Q9EQC0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chst1Q9EQC0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Chst1Q9EQC0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chst1Q9EQC0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chst1Q9EQC0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chst1Q9EQC0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Chst1Q9EQC0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Chst1Q9EQC0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Chst1Q9EQC0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Chst1Q9EQC0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chst1Q9EQC0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chst1Q9EQC0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Chst1Q9EQC0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chst1Q9EQC0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chst1Q9EQC0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chst1Q9EQC0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chst1Q9EQC0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chst1Q9EQC0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chst1Q9EQC0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chst1Q9EQC0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chst1Q9EQC0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chst1Q9EQC0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chst1Q9EQC0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chst1Q9EQC0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chst1Q9EQC0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chst1Q9EQC0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chst1Q9EQC0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chst1Q9EQC0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chst1Q9EQC0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chst1Q9EQC0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Chst1Q9EQC0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Chst1Q9EQC0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chst1Q9EQC0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Chst1Q9EQC0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chst1Q9EQC0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chst1Q9EQC0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chst1Q9EQC0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chst1Q9EQC0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chst1Q9EQC0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chst1Q9EQC0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chst1Q9EQC0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chst1Q9EQC0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chst1Q9EQC0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chst1Q9EQC0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Chst1Q9EQC0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Chst1Q9EQC0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chst1Q9EQC0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chst1Q9EQC0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chst1Q9EQC0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chst1Q9EQC0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chst1Q9EQC0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chst1Q9EQC0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chst1Q9EQC0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chst1Q9EQC0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chst1Q9EQC0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chst1Q9EQC0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chst1Q9EQC0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chst1Q9EQC0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chst1Q9EQC0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chst1Q9EQC0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chst1Q9EQC0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Chst1Q9EQC0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Chst1Q9EQC0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Chst1Q9EQC0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Chst1Q9EQC0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Chst1Q9EQC0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Chst1Q9EQC0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Chst1Q9EQC0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms