Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT2

Ndufs3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs3Q9DCT2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ndufs3Q9DCT2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ndufs3Q9DCT2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ndufs3Q9DCT2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ndufs3Q9DCT2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ndufs3Q9DCT2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ndufs3Q9DCT2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ndufs3Q9DCT2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ndufs3Q9DCT2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ndufs3Q9DCT2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ndufs3Q9DCT2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ndufs3Q9DCT2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ndufs3Q9DCT2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ndufs3Q9DCT2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ndufs3Q9DCT2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ndufs3Q9DCT2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ndufs3Q9DCT2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ndufs3Q9DCT2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ndufs3Q9DCT2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ndufs3Q9DCT2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ndufs3Q9DCT2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ndufs3Q9DCT2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ndufs3Q9DCT2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ndufs3Q9DCT2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ndufs3Q9DCT2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ndufs3Q9DCT2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ndufs3Q9DCT2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ndufs3Q9DCT2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ndufs3Q9DCT2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ndufs3Q9DCT2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ndufs3Q9DCT2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ndufs3Q9DCT2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ndufs3Q9DCT2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ndufs3Q9DCT2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ndufs3Q9DCT2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ndufs3Q9DCT2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ndufs3Q9DCT2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ndufs3Q9DCT2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ndufs3Q9DCT2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ndufs3Q9DCT2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ndufs3Q9DCT2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ndufs3Q9DCT2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ndufs3Q9DCT2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ndufs3Q9DCT2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ndufs3Q9DCT2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ndufs3Q9DCT2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ndufs3Q9DCT2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ndufs3Q9DCT2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ndufs3Q9DCT2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ndufs3Q9DCT2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ndufs3Q9DCT2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ndufs3Q9DCT2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ndufs3Q9DCT2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ndufs3Q9DCT2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ndufs3Q9DCT2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Ndufs3Q9DCT2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ndufs3Q9DCT2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ndufs3Q9DCT2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ndufs3Q9DCT2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ndufs3Q9DCT2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ndufs3Q9DCT2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ndufs3Q9DCT2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ndufs3Q9DCT2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ndufs3Q9DCT2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ndufs3Q9DCT2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ndufs3Q9DCT2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ndufs3Q9DCT2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ndufs3Q9DCT2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ndufs3Q9DCT2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ndufs3Q9DCT2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ndufs3Q9DCT2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ndufs3Q9DCT2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ndufs3Q9DCT2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ndufs3Q9DCT2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ndufs3Q9DCT2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ndufs3Q9DCT2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ndufs3Q9DCT2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ndufs3Q9DCT2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ndufs3Q9DCT2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ndufs3Q9DCT2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ndufs3Q9DCT2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ndufs3Q9DCT2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ndufs3Q9DCT2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Ndufs3Q9DCT2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ndufs3Q9DCT2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ndufs3Q9DCT2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ndufs3Q9DCT2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ndufs3Q9DCT2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ndufs3Q9DCT2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ndufs3Q9DCT2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ndufs3Q9DCT2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ndufs3Q9DCT2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ndufs3Q9DCT2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ndufs3Q9DCT2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ndufs3Q9DCT2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ndufs3Q9DCT2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ndufs3Q9DCT2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ndufs3Q9DCT2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ndufs3Q9DCT2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ndufs3Q9DCT2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms