Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN1

Nudt12, Peroxisomal NADH pyrophosphatase NUDT12, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt12Q9DCN1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nudt12Q9DCN1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nudt12Q9DCN1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nudt12Q9DCN1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nudt12Q9DCN1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nudt12Q9DCN1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nudt12Q9DCN1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nudt12Q9DCN1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nudt12Q9DCN1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nudt12Q9DCN1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Nudt12Q9DCN1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nudt12Q9DCN1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nudt12Q9DCN1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nudt12Q9DCN1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nudt12Q9DCN1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nudt12Q9DCN1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nudt12Q9DCN1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nudt12Q9DCN1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nudt12Q9DCN1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nudt12Q9DCN1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nudt12Q9DCN1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nudt12Q9DCN1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nudt12Q9DCN1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nudt12Q9DCN1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Nudt12Q9DCN1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nudt12Q9DCN1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nudt12Q9DCN1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nudt12Q9DCN1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nudt12Q9DCN1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nudt12Q9DCN1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nudt12Q9DCN1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nudt12Q9DCN1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nudt12Q9DCN1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Nudt12Q9DCN1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nudt12Q9DCN1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Nudt12Q9DCN1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Nudt12Q9DCN1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nudt12Q9DCN1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nudt12Q9DCN1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nudt12Q9DCN1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nudt12Q9DCN1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nudt12Q9DCN1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nudt12Q9DCN1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nudt12Q9DCN1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nudt12Q9DCN1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nudt12Q9DCN1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nudt12Q9DCN1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nudt12Q9DCN1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nudt12Q9DCN1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nudt12Q9DCN1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nudt12Q9DCN1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nudt12Q9DCN1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Nudt12Q9DCN1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nudt12Q9DCN1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nudt12Q9DCN1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nudt12Q9DCN1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nudt12Q9DCN1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nudt12Q9DCN1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nudt12Q9DCN1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nudt12Q9DCN1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nudt12Q9DCN1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nudt12Q9DCN1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nudt12Q9DCN1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Nudt12Q9DCN1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nudt12Q9DCN1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nudt12Q9DCN1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Nudt12Q9DCN1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nudt12Q9DCN1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nudt12Q9DCN1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nudt12Q9DCN1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nudt12Q9DCN1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nudt12Q9DCN1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Nudt12Q9DCN1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nudt12Q9DCN1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nudt12Q9DCN1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nudt12Q9DCN1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nudt12Q9DCN1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nudt12Q9DCN1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nudt12Q9DCN1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nudt12Q9DCN1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Nudt12Q9DCN1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nudt12Q9DCN1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nudt12Q9DCN1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nudt12Q9DCN1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nudt12Q9DCN1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nudt12Q9DCN1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nudt12Q9DCN1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Nudt12Q9DCN1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Nudt12Q9DCN1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nudt12Q9DCN1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nudt12Q9DCN1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nudt12Q9DCN1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nudt12Q9DCN1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nudt12Q9DCN1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nudt12Q9DCN1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nudt12Q9DCN1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nudt12Q9DCN1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nudt12Q9DCN1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nudt12Q9DCN1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nudt12Q9DCN1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms