Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Rnf6Q9DBU5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rnf6Q9DBU5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rnf6Q9DBU5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rnf6Q9DBU5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rnf6Q9DBU5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Rnf6Q9DBU5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rnf6Q9DBU5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rnf6Q9DBU5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rnf6Q9DBU5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf6Q9DBU5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf6Q9DBU5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rnf6Q9DBU5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnf6Q9DBU5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnf6Q9DBU5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnf6Q9DBU5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnf6Q9DBU5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnf6Q9DBU5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnf6Q9DBU5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnf6Q9DBU5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnf6Q9DBU5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnf6Q9DBU5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Rnf6Q9DBU5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf6Q9DBU5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf6Q9DBU5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf6Q9DBU5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf6Q9DBU5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf6Q9DBU5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf6Q9DBU5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf6Q9DBU5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf6Q9DBU5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf6Q9DBU5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf6Q9DBU5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf6Q9DBU5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnf6Q9DBU5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnf6Q9DBU5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf6Q9DBU5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf6Q9DBU5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf6Q9DBU5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf6Q9DBU5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf6Q9DBU5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf6Q9DBU5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf6Q9DBU5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf6Q9DBU5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf6Q9DBU5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rnf6Q9DBU5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rnf6Q9DBU5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rnf6Q9DBU5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rnf6Q9DBU5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rnf6Q9DBU5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rnf6Q9DBU5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf6Q9DBU5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf6Q9DBU5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf6Q9DBU5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf6Q9DBU5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf6Q9DBU5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rnf6Q9DBU5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Rnf6Q9DBU5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rnf6Q9DBU5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf6Q9DBU5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf6Q9DBU5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rnf6Q9DBU5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rnf6Q9DBU5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rnf6Q9DBU5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rnf6Q9DBU5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnf6Q9DBU5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnf6Q9DBU5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnf6Q9DBU5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnf6Q9DBU5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnf6Q9DBU5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf6Q9DBU5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf6Q9DBU5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf6Q9DBU5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf6Q9DBU5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf6Q9DBU5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf6Q9DBU5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf6Q9DBU5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf6Q9DBU5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf6Q9DBU5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf6Q9DBU5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf6Q9DBU5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf6Q9DBU5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnf6Q9DBU5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnf6Q9DBU5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnf6Q9DBU5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnf6Q9DBU5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnf6Q9DBU5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnf6Q9DBU5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnf6Q9DBU5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf6Q9DBU5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf6Q9DBU5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf6Q9DBU5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf6Q9DBU5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf6Q9DBU5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf6Q9DBU5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf6Q9DBU5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rnf6Q9DBU5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rnf6Q9DBU5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rnf6Q9DBU5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rnf6Q9DBU5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms