Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SrpraQ9DBG7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SrpraQ9DBG7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SrpraQ9DBG7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SrpraQ9DBG7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SrpraQ9DBG7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SrpraQ9DBG7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SrpraQ9DBG7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SrpraQ9DBG7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SrpraQ9DBG7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SrpraQ9DBG7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SrpraQ9DBG7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SrpraQ9DBG7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SrpraQ9DBG7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SrpraQ9DBG7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SrpraQ9DBG7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SrpraQ9DBG7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SrpraQ9DBG7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SrpraQ9DBG7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SrpraQ9DBG7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SrpraQ9DBG7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SrpraQ9DBG7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SrpraQ9DBG7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SrpraQ9DBG7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SrpraQ9DBG7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SrpraQ9DBG7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SrpraQ9DBG7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SrpraQ9DBG7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SrpraQ9DBG7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SrpraQ9DBG7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SrpraQ9DBG7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SrpraQ9DBG7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SrpraQ9DBG7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SrpraQ9DBG7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SrpraQ9DBG7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SrpraQ9DBG7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SrpraQ9DBG7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SrpraQ9DBG7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SrpraQ9DBG7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SrpraQ9DBG7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SrpraQ9DBG7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SrpraQ9DBG7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SrpraQ9DBG7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SrpraQ9DBG7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SrpraQ9DBG7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SrpraQ9DBG7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SrpraQ9DBG7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SrpraQ9DBG7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SrpraQ9DBG7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SrpraQ9DBG7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SrpraQ9DBG7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SrpraQ9DBG7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SrpraQ9DBG7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SrpraQ9DBG7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SrpraQ9DBG7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SrpraQ9DBG7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SrpraQ9DBG7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SrpraQ9DBG7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SrpraQ9DBG7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SrpraQ9DBG7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SrpraQ9DBG7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SrpraQ9DBG7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SrpraQ9DBG7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SrpraQ9DBG7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SrpraQ9DBG7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SrpraQ9DBG7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SrpraQ9DBG7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SrpraQ9DBG7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SrpraQ9DBG7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SrpraQ9DBG7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SrpraQ9DBG7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SrpraQ9DBG7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SrpraQ9DBG7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SrpraQ9DBG7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SrpraQ9DBG7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SrpraQ9DBG7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SrpraQ9DBG7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SrpraQ9DBG7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SrpraQ9DBG7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SrpraQ9DBG7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SrpraQ9DBG7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SrpraQ9DBG7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SrpraQ9DBG7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SrpraQ9DBG7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SrpraQ9DBG7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SrpraQ9DBG7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SrpraQ9DBG7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SrpraQ9DBG7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SrpraQ9DBG7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SrpraQ9DBG7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SrpraQ9DBG7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SrpraQ9DBG7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SrpraQ9DBG7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SrpraQ9DBG7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SrpraQ9DBG7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SrpraQ9DBG7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SrpraQ9DBG7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SrpraQ9DBG7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SrpraQ9DBG7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SrpraQ9DBG7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms