Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P4

Mrpl17, 39S ribosomal protein L17, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl17Q9D8P4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mrpl17Q9D8P4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mrpl17Q9D8P4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mrpl17Q9D8P4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mrpl17Q9D8P4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mrpl17Q9D8P4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mrpl17Q9D8P4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Mrpl17Q9D8P4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mrpl17Q9D8P4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mrpl17Q9D8P4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mrpl17Q9D8P4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mrpl17Q9D8P4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mrpl17Q9D8P4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mrpl17Q9D8P4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mrpl17Q9D8P4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mrpl17Q9D8P4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mrpl17Q9D8P4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mrpl17Q9D8P4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mrpl17Q9D8P4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mrpl17Q9D8P4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Mrpl17Q9D8P4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mrpl17Q9D8P4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mrpl17Q9D8P4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mrpl17Q9D8P4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mrpl17Q9D8P4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mrpl17Q9D8P4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mrpl17Q9D8P4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mrpl17Q9D8P4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mrpl17Q9D8P4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mrpl17Q9D8P4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mrpl17Q9D8P4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mrpl17Q9D8P4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mrpl17Q9D8P4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mrpl17Q9D8P4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mrpl17Q9D8P4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mrpl17Q9D8P4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mrpl17Q9D8P4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mrpl17Q9D8P4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mrpl17Q9D8P4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Mrpl17Q9D8P4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mrpl17Q9D8P4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mrpl17Q9D8P4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mrpl17Q9D8P4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mrpl17Q9D8P4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mrpl17Q9D8P4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mrpl17Q9D8P4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Mrpl17Q9D8P4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mrpl17Q9D8P4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mrpl17Q9D8P4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mrpl17Q9D8P4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mrpl17Q9D8P4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mrpl17Q9D8P4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mrpl17Q9D8P4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mrpl17Q9D8P4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mrpl17Q9D8P4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mrpl17Q9D8P4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mrpl17Q9D8P4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mrpl17Q9D8P4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Mrpl17Q9D8P4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Mrpl17Q9D8P4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mrpl17Q9D8P4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mrpl17Q9D8P4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mrpl17Q9D8P4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mrpl17Q9D8P4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mrpl17Q9D8P4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mrpl17Q9D8P4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mrpl17Q9D8P4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mrpl17Q9D8P4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mrpl17Q9D8P4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mrpl17Q9D8P4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Mrpl17Q9D8P4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mrpl17Q9D8P4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mrpl17Q9D8P4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mrpl17Q9D8P4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mrpl17Q9D8P4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mrpl17Q9D8P4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mrpl17Q9D8P4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Mrpl17Q9D8P4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mrpl17Q9D8P4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mrpl17Q9D8P4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mrpl17Q9D8P4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Mrpl17Q9D8P4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Mrpl17Q9D8P4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mrpl17Q9D8P4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mrpl17Q9D8P4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mrpl17Q9D8P4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mrpl17Q9D8P4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mrpl17Q9D8P4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mrpl17Q9D8P4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mrpl17Q9D8P4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mrpl17Q9D8P4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mrpl17Q9D8P4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mrpl17Q9D8P4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mrpl17Q9D8P4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mrpl17Q9D8P4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Mrpl17Q9D8P4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mrpl17Q9D8P4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mrpl17Q9D8P4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mrpl17Q9D8P4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mrpl17Q9D8P4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms