Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Chmp4cQ9D7F7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Chmp4cQ9D7F7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Chmp4cQ9D7F7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Chmp4cQ9D7F7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Chmp4cQ9D7F7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Chmp4cQ9D7F7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Chmp4cQ9D7F7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Chmp4cQ9D7F7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Chmp4cQ9D7F7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Chmp4cQ9D7F7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Chmp4cQ9D7F7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Chmp4cQ9D7F7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Chmp4cQ9D7F7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Chmp4cQ9D7F7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Chmp4cQ9D7F7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Chmp4cQ9D7F7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Chmp4cQ9D7F7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Chmp4cQ9D7F7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Chmp4cQ9D7F7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Chmp4cQ9D7F7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Chmp4cQ9D7F7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Chmp4cQ9D7F7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Chmp4cQ9D7F7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Chmp4cQ9D7F7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Chmp4cQ9D7F7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Chmp4cQ9D7F7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Chmp4cQ9D7F7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Chmp4cQ9D7F7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Chmp4cQ9D7F7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Chmp4cQ9D7F7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Chmp4cQ9D7F7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Chmp4cQ9D7F7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Chmp4cQ9D7F7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Chmp4cQ9D7F7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Chmp4cQ9D7F7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Chmp4cQ9D7F7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Chmp4cQ9D7F7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Chmp4cQ9D7F7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Chmp4cQ9D7F7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Chmp4cQ9D7F7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Chmp4cQ9D7F7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Chmp4cQ9D7F7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Chmp4cQ9D7F7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Chmp4cQ9D7F7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Chmp4cQ9D7F7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Chmp4cQ9D7F7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Chmp4cQ9D7F7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Chmp4cQ9D7F7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Chmp4cQ9D7F7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Chmp4cQ9D7F7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Chmp4cQ9D7F7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Chmp4cQ9D7F7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Chmp4cQ9D7F7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Chmp4cQ9D7F7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Chmp4cQ9D7F7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Chmp4cQ9D7F7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Chmp4cQ9D7F7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Chmp4cQ9D7F7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Chmp4cQ9D7F7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Chmp4cQ9D7F7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Chmp4cQ9D7F7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Chmp4cQ9D7F7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Chmp4cQ9D7F7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Chmp4cQ9D7F7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Chmp4cQ9D7F7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Chmp4cQ9D7F7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Chmp4cQ9D7F7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chmp4cQ9D7F7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chmp4cQ9D7F7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chmp4cQ9D7F7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chmp4cQ9D7F7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chmp4cQ9D7F7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chmp4cQ9D7F7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Chmp4cQ9D7F7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Chmp4cQ9D7F7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Chmp4cQ9D7F7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Chmp4cQ9D7F7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Chmp4cQ9D7F7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Chmp4cQ9D7F7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Chmp4cQ9D7F7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Chmp4cQ9D7F7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Chmp4cQ9D7F7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Chmp4cQ9D7F7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Chmp4cQ9D7F7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Chmp4cQ9D7F7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Chmp4cQ9D7F7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Chmp4cQ9D7F7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Chmp4cQ9D7F7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Chmp4cQ9D7F7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Chmp4cQ9D7F7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Chmp4cQ9D7F7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Chmp4cQ9D7F7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Chmp4cQ9D7F7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Chmp4cQ9D7F7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Chmp4cQ9D7F7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Chmp4cQ9D7F7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Chmp4cQ9D7F7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Chmp4cQ9D7F7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Chmp4cQ9D7F7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms