Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6B9

Hrct1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hrct1Q9D6B9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hrct1Q9D6B9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hrct1Q9D6B9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hrct1Q9D6B9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hrct1Q9D6B9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Hrct1Q9D6B9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hrct1Q9D6B9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hrct1Q9D6B9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hrct1Q9D6B9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hrct1Q9D6B9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hrct1Q9D6B9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hrct1Q9D6B9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hrct1Q9D6B9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hrct1Q9D6B9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hrct1Q9D6B9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hrct1Q9D6B9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hrct1Q9D6B9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hrct1Q9D6B9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hrct1Q9D6B9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hrct1Q9D6B9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hrct1Q9D6B9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hrct1Q9D6B9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hrct1Q9D6B9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hrct1Q9D6B9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hrct1Q9D6B9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hrct1Q9D6B9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hrct1Q9D6B9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hrct1Q9D6B9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hrct1Q9D6B9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hrct1Q9D6B9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hrct1Q9D6B9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hrct1Q9D6B9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hrct1Q9D6B9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hrct1Q9D6B9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hrct1Q9D6B9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hrct1Q9D6B9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hrct1Q9D6B9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hrct1Q9D6B9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hrct1Q9D6B9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hrct1Q9D6B9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hrct1Q9D6B9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hrct1Q9D6B9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hrct1Q9D6B9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hrct1Q9D6B9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hrct1Q9D6B9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hrct1Q9D6B9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hrct1Q9D6B9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hrct1Q9D6B9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hrct1Q9D6B9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hrct1Q9D6B9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hrct1Q9D6B9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hrct1Q9D6B9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hrct1Q9D6B9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hrct1Q9D6B9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hrct1Q9D6B9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hrct1Q9D6B9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hrct1Q9D6B9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hrct1Q9D6B9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hrct1Q9D6B9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hrct1Q9D6B9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hrct1Q9D6B9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hrct1Q9D6B9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hrct1Q9D6B9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hrct1Q9D6B9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hrct1Q9D6B9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hrct1Q9D6B9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hrct1Q9D6B9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hrct1Q9D6B9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hrct1Q9D6B9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hrct1Q9D6B9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hrct1Q9D6B9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hrct1Q9D6B9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hrct1Q9D6B9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hrct1Q9D6B9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hrct1Q9D6B9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hrct1Q9D6B9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hrct1Q9D6B9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hrct1Q9D6B9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hrct1Q9D6B9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hrct1Q9D6B9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hrct1Q9D6B9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hrct1Q9D6B9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hrct1Q9D6B9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hrct1Q9D6B9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hrct1Q9D6B9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hrct1Q9D6B9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hrct1Q9D6B9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hrct1Q9D6B9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hrct1Q9D6B9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hrct1Q9D6B9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hrct1Q9D6B9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hrct1Q9D6B9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hrct1Q9D6B9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hrct1Q9D6B9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hrct1Q9D6B9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hrct1Q9D6B9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hrct1Q9D6B9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hrct1Q9D6B9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hrct1Q9D6B9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hrct1Q9D6B9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.7 ms