Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sf3a3Q9D554 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sf3a3Q9D554 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sf3a3Q9D554 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sf3a3Q9D554 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sf3a3Q9D554 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sf3a3Q9D554 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sf3a3Q9D554 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sf3a3Q9D554 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sf3a3Q9D554 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sf3a3Q9D554 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sf3a3Q9D554 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sf3a3Q9D554 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sf3a3Q9D554 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sf3a3Q9D554 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sf3a3Q9D554 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sf3a3Q9D554 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sf3a3Q9D554 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sf3a3Q9D554 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sf3a3Q9D554 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sf3a3Q9D554 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sf3a3Q9D554 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sf3a3Q9D554 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sf3a3Q9D554 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sf3a3Q9D554 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sf3a3Q9D554 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sf3a3Q9D554 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Sf3a3Q9D554 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sf3a3Q9D554 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sf3a3Q9D554 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sf3a3Q9D554 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sf3a3Q9D554 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sf3a3Q9D554 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sf3a3Q9D554 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sf3a3Q9D554 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sf3a3Q9D554 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sf3a3Q9D554 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sf3a3Q9D554 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sf3a3Q9D554 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sf3a3Q9D554 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sf3a3Q9D554 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sf3a3Q9D554 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sf3a3Q9D554 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sf3a3Q9D554 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sf3a3Q9D554 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sf3a3Q9D554 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sf3a3Q9D554 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sf3a3Q9D554 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sf3a3Q9D554 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sf3a3Q9D554 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Sf3a3Q9D554 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Sf3a3Q9D554 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sf3a3Q9D554 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sf3a3Q9D554 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sf3a3Q9D554 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sf3a3Q9D554 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sf3a3Q9D554 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sf3a3Q9D554 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sf3a3Q9D554 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sf3a3Q9D554 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sf3a3Q9D554 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sf3a3Q9D554 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sf3a3Q9D554 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sf3a3Q9D554 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sf3a3Q9D554 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sf3a3Q9D554 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sf3a3Q9D554 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sf3a3Q9D554 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sf3a3Q9D554 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sf3a3Q9D554 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Sf3a3Q9D554 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sf3a3Q9D554 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sf3a3Q9D554 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sf3a3Q9D554 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sf3a3Q9D554 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sf3a3Q9D554 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sf3a3Q9D554 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sf3a3Q9D554 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sf3a3Q9D554 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sf3a3Q9D554 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sf3a3Q9D554 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sf3a3Q9D554 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sf3a3Q9D554 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sf3a3Q9D554 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sf3a3Q9D554 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Sf3a3Q9D554 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sf3a3Q9D554 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sf3a3Q9D554 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sf3a3Q9D554 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sf3a3Q9D554 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sf3a3Q9D554 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sf3a3Q9D554 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sf3a3Q9D554 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sf3a3Q9D554 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sf3a3Q9D554 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sf3a3Q9D554 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sf3a3Q9D554 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sf3a3Q9D554 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sf3a3Q9D554 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sf3a3Q9D554 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.6 ms