Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q1

Ribc2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc2Q9D4Q1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ribc2Q9D4Q1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ribc2Q9D4Q1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ribc2Q9D4Q1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ribc2Q9D4Q1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ribc2Q9D4Q1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ribc2Q9D4Q1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ribc2Q9D4Q1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ribc2Q9D4Q1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ribc2Q9D4Q1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ribc2Q9D4Q1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ribc2Q9D4Q1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ribc2Q9D4Q1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ribc2Q9D4Q1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ribc2Q9D4Q1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ribc2Q9D4Q1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ribc2Q9D4Q1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ribc2Q9D4Q1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ribc2Q9D4Q1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ribc2Q9D4Q1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ribc2Q9D4Q1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ribc2Q9D4Q1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ribc2Q9D4Q1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ribc2Q9D4Q1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ribc2Q9D4Q1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ribc2Q9D4Q1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ribc2Q9D4Q1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ribc2Q9D4Q1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ribc2Q9D4Q1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ribc2Q9D4Q1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ribc2Q9D4Q1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ribc2Q9D4Q1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ribc2Q9D4Q1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ribc2Q9D4Q1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ribc2Q9D4Q1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ribc2Q9D4Q1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ribc2Q9D4Q1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ribc2Q9D4Q1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ribc2Q9D4Q1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ribc2Q9D4Q1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ribc2Q9D4Q1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ribc2Q9D4Q1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ribc2Q9D4Q1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ribc2Q9D4Q1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ribc2Q9D4Q1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ribc2Q9D4Q1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ribc2Q9D4Q1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ribc2Q9D4Q1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ribc2Q9D4Q1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ribc2Q9D4Q1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ribc2Q9D4Q1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ribc2Q9D4Q1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ribc2Q9D4Q1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ribc2Q9D4Q1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ribc2Q9D4Q1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ribc2Q9D4Q1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Ribc2Q9D4Q1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ribc2Q9D4Q1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ribc2Q9D4Q1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ribc2Q9D4Q1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Ribc2Q9D4Q1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ribc2Q9D4Q1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ribc2Q9D4Q1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ribc2Q9D4Q1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ribc2Q9D4Q1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ribc2Q9D4Q1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ribc2Q9D4Q1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ribc2Q9D4Q1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ribc2Q9D4Q1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ribc2Q9D4Q1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ribc2Q9D4Q1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ribc2Q9D4Q1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ribc2Q9D4Q1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ribc2Q9D4Q1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ribc2Q9D4Q1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ribc2Q9D4Q1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ribc2Q9D4Q1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ribc2Q9D4Q1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ribc2Q9D4Q1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ribc2Q9D4Q1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ribc2Q9D4Q1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ribc2Q9D4Q1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ribc2Q9D4Q1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ribc2Q9D4Q1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ribc2Q9D4Q1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ribc2Q9D4Q1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ribc2Q9D4Q1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ribc2Q9D4Q1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ribc2Q9D4Q1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ribc2Q9D4Q1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ribc2Q9D4Q1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ribc2Q9D4Q1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ribc2Q9D4Q1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ribc2Q9D4Q1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ribc2Q9D4Q1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ribc2Q9D4Q1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ribc2Q9D4Q1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ribc2Q9D4Q1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ribc2Q9D4Q1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ribc2Q9D4Q1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms