Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J9

4931423N10Rik, MCG52616, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931423N10RikQ9D4J9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
4931423N10RikQ9D4J9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
4931423N10RikQ9D4J9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
4931423N10RikQ9D4J9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
4931423N10RikQ9D4J9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
4931423N10RikQ9D4J9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
4931423N10RikQ9D4J9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
4931423N10RikQ9D4J9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
4931423N10RikQ9D4J9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
4931423N10RikQ9D4J9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
4931423N10RikQ9D4J9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
4931423N10RikQ9D4J9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
4931423N10RikQ9D4J9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
4931423N10RikQ9D4J9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
4931423N10RikQ9D4J9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
4931423N10RikQ9D4J9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
4931423N10RikQ9D4J9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
4931423N10RikQ9D4J9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
4931423N10RikQ9D4J9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
4931423N10RikQ9D4J9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
4931423N10RikQ9D4J9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
4931423N10RikQ9D4J9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
4931423N10RikQ9D4J9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
4931423N10RikQ9D4J9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
4931423N10RikQ9D4J9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
4931423N10RikQ9D4J9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
4931423N10RikQ9D4J9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
4931423N10RikQ9D4J9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
4931423N10RikQ9D4J9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
4931423N10RikQ9D4J9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
4931423N10RikQ9D4J9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
4931423N10RikQ9D4J9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
4931423N10RikQ9D4J9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
4931423N10RikQ9D4J9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
4931423N10RikQ9D4J9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
4931423N10RikQ9D4J9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
4931423N10RikQ9D4J9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
4931423N10RikQ9D4J9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
4931423N10RikQ9D4J9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
4931423N10RikQ9D4J9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
4931423N10RikQ9D4J9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
4931423N10RikQ9D4J9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
4931423N10RikQ9D4J9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
4931423N10RikQ9D4J9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
4931423N10RikQ9D4J9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
4931423N10RikQ9D4J9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
4931423N10RikQ9D4J9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
4931423N10RikQ9D4J9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
4931423N10RikQ9D4J9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
4931423N10RikQ9D4J9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
4931423N10RikQ9D4J9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
4931423N10RikQ9D4J9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
4931423N10RikQ9D4J9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
4931423N10RikQ9D4J9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
4931423N10RikQ9D4J9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
4931423N10RikQ9D4J9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
4931423N10RikQ9D4J9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
4931423N10RikQ9D4J9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
4931423N10RikQ9D4J9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
4931423N10RikQ9D4J9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
4931423N10RikQ9D4J9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
4931423N10RikQ9D4J9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
4931423N10RikQ9D4J9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
4931423N10RikQ9D4J9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
4931423N10RikQ9D4J9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
4931423N10RikQ9D4J9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
4931423N10RikQ9D4J9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
4931423N10RikQ9D4J9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
4931423N10RikQ9D4J9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
4931423N10RikQ9D4J9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
4931423N10RikQ9D4J9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
4931423N10RikQ9D4J9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
4931423N10RikQ9D4J9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
4931423N10RikQ9D4J9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
4931423N10RikQ9D4J9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
4931423N10RikQ9D4J9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4931423N10RikQ9D4J9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4931423N10RikQ9D4J9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
4931423N10RikQ9D4J9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
4931423N10RikQ9D4J9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
4931423N10RikQ9D4J9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
4931423N10RikQ9D4J9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
4931423N10RikQ9D4J9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
4931423N10RikQ9D4J9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
4931423N10RikQ9D4J9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
4931423N10RikQ9D4J9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
4931423N10RikQ9D4J9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
4931423N10RikQ9D4J9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
4931423N10RikQ9D4J9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
4931423N10RikQ9D4J9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
4931423N10RikQ9D4J9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
4931423N10RikQ9D4J9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
4931423N10RikQ9D4J9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
4931423N10RikQ9D4J9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
4931423N10RikQ9D4J9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
4931423N10RikQ9D4J9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
4931423N10RikQ9D4J9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
4931423N10RikQ9D4J9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
4931423N10RikQ9D4J9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
4931423N10RikQ9D4J9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms